26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2974 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2974  peptidase  100 
 
 		 90 aa  182  9e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.561027  normal  0.577103 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1861  peptidase  85.56 
 
 		 90 aa  149  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.746884  normal  0.0400575 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2589  hypothetical protein  49.3 
 
 		 88 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0869265 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3074  hypothetical protein  45.98 
 
 		 86 aa  68.9  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2565  hypothetical protein  41.98 
 
 		 89 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.84434  normal  0.433178 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1783  hypothetical protein  48.48 
 
 		 87 aa  63.9  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0218342  normal  0.0624133 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1313  hypothetical protein  40.91 
 
 		 87 aa  60.8  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0651  hypothetical protein  37.8 
 
 		 90 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.248101  normal  0.0865626 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0640  hypothetical protein  44.78 
 
 		 90 aa  57.8  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.377237  normal  0.24293 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3763  hypothetical protein  41.33 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3781  hypothetical protein  39.66 
 
 		 211 aa  52.8  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1643  hypothetical protein  37.97 
 
 		 88 aa  50.8  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1899  hypothetical protein  28.74 
 
 		 87 aa  45.1  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.494272  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0560  hypothetical protein  38.57 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0672  hypothetical protein  38.57 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.440129  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2075  hypothetical protein  38.57 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.136356  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1625  hypothetical protein  38.57 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.045031  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0783  hypothetical protein  38.57 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.143696  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0619  hypothetical protein  40.82 
 
 		 99 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.669584 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3141  hypothetical protein  42.62 
 
 		 86 aa  41.6  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1978  hypothetical protein  37.14 
 
 		 147 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.682299  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0491  hypothetical protein  37.14 
 
 		 147 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.787236  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2198  hypothetical protein  39.34 
 
 		 86 aa  40.4  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1863  hypothetical protein  39.34 
 
 		 86 aa  40.4  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3764  membrane protein  42.86 
 
 		 96 aa  40  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.915458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1814  hypothetical protein  39.34 
 
 		 86 aa  40  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.882506  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>