More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1834 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_2209  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  97.83 
 
 
368 aa  748    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331992  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3683  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  83.56 
 
 
369 aa  642    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3529  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  97.28 
 
 
368 aa  742    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.318249  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3461  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  97.01 
 
 
368 aa  736    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.937677  normal  0.571414 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1834  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  100 
 
 
368 aa  759    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47300  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  79.51 
 
 
371 aa  615  1e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4081  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  79.23 
 
 
371 aa  611  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5871  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  68.98 
 
 
375 aa  525  1e-148  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187739  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0967  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  68.14 
 
 
373 aa  522  1e-147  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00178187  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3216  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  68.31 
 
 
374 aa  513  1e-144  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.109288  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6497  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  65.75 
 
 
376 aa  499  1e-140  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.453974  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3718  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  63.64 
 
 
378 aa  492  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3138  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  65.75 
 
 
376 aa  490  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000150503 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3162  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  66.3 
 
 
376 aa  487  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.805462  normal  0.0318319 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5064  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  61.73 
 
 
370 aa  456  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686649  normal  0.761871 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0347  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  60.66 
 
 
369 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.26402  normal  0.54859 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4697  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  61.1 
 
 
372 aa  447  1.0000000000000001e-124  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.770845 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5190  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  60.94 
 
 
373 aa  443  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4662  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  61.22 
 
 
369 aa  442  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.743349  normal  0.408285 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3066  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  61.33 
 
 
369 aa  435  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.779226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5301  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  61.33 
 
 
369 aa  435  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.992518  normal  0.0407787 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1876  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  61.7 
 
 
376 aa  432  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.188417 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2055  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  60.94 
 
 
369 aa  429  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.669948  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4967  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  64.04 
 
 
369 aa  428  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0476873 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3422  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  63.87 
 
 
369 aa  426  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.157145  normal  0.100623 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1756  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  59.56 
 
 
369 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.029748  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0852  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  59.56 
 
 
369 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.195765  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2210  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  59.56 
 
 
369 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0582  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  59.83 
 
 
369 aa  423  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1899  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  59.83 
 
 
369 aa  423  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0485  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  59.83 
 
 
369 aa  423  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.538126  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0895  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  59.56 
 
 
369 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.102391  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4874  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  51.66 
 
 
398 aa  402  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428522  normal  0.556954 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2142  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  52.76 
 
 
410 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2116  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  51.38 
 
 
410 aa  390  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000767  2-aminoethylphosphonate:pyruvate aminotransferase  44.2 
 
 
367 aa  337  1.9999999999999998e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04876  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  44.48 
 
 
400 aa  337  2.9999999999999997e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0546  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  44.11 
 
 
367 aa  334  2e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000447311  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1240  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  41.23 
 
 
365 aa  331  1e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1216  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  41.23 
 
 
365 aa  331  1e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1241  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  42.34 
 
 
365 aa  331  1e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0812  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  43.29 
 
 
376 aa  331  1e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.322555  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1415  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  41.23 
 
 
365 aa  331  1e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.806093 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1341  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  41.23 
 
 
365 aa  331  1e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1218  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  41.23 
 
 
365 aa  330  2e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2895  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  44.2 
 
 
371 aa  330  2e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.011056 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3966  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  41.5 
 
 
365 aa  329  4e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1440  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  41.23 
 
 
365 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1378  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  41.23 
 
 
365 aa  326  3e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1481  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  40.95 
 
 
365 aa  325  6e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1052  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  41.13 
 
 
365 aa  325  8.000000000000001e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0491  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  42.86 
 
 
367 aa  323  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0470  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  41.92 
 
 
367 aa  322  6e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0533  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  41.64 
 
 
367 aa  320  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0478  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  41.64 
 
 
367 aa  320  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.168987  normal  0.470271 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0472  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  42.3 
 
 
367 aa  320  3.9999999999999996e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.456541  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3422  2-aminoethylphosphonate/pyruvate transaminase  39.06 
 
 
370 aa  319  3.9999999999999996e-86  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2747  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  42.19 
 
 
368 aa  303  4.0000000000000003e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1165  aminotransferase, class V  41.18 
 
 
363 aa  293  4e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2312  2-aminoethylphosphonate/pyruvate transaminase  42.06 
 
 
368 aa  289  6e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7778  aminotransferase class V  37.83 
 
 
383 aa  246  6e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3820  2-aminoethylphosphonate aminotransferase  36.68 
 
 
363 aa  202  8e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154189  normal  0.305313 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1810  class V aminotransferase  36.31 
 
 
355 aa  200  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00984948  normal  0.0716447 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1315  aminotransferase, class V  35.46 
 
 
356 aa  195  1e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.754091  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1415  nucleotidyl transferase/aminotransferase, class V  31.73 
 
 
616 aa  191  1e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2233  putative aminotransferase class-V  33.98 
 
 
355 aa  191  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5997  2-aminoethylphosphonate aminotransferase  33.98 
 
 
355 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.762607  normal  0.379829 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1910  2-aminoethylphosphonate-pyruvate transaminase  35.26 
 
 
355 aa  188  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0778  2-aminoethylphosphonate-pyruvate transaminase  36.71 
 
 
355 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2063  2-aminoethylphosphonate-pyruvate transaminase  36.71 
 
 
355 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.302236  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0689  2-aminoethylphosphonate-pyruvate transaminase  36.71 
 
 
355 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1770  2-aminoethylphosphonate-pyruvate transaminase  36.42 
 
 
355 aa  187  3e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2028  2-aminoethylphosphonate-pyruvate transaminase  36.42 
 
 
355 aa  187  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1053  2-aminoethylphosphonate-pyruvate transaminase  36.42 
 
 
355 aa  187  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0760  2-aminoethylphosphonate-pyruvate transaminase  36.42 
 
 
355 aa  187  3e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4473  2-aminoethylphosphonate aminotransferase  34.62 
 
 
354 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.220366  normal  0.726481 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3533  aminotransferase, class V  34.16 
 
 
354 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4014  2-aminoethylphosphonate aminotransferase  33.88 
 
 
354 aa  182  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4247  aminotransferase, class V  35.34 
 
 
354 aa  180  4e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4119  aminotransferase, class V  35.34 
 
 
354 aa  180  4e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142749  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3400  2-aminoethylphosphonate aminotransferase  34.77 
 
 
354 aa  176  8e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1916  aminotransferase, class V  34.48 
 
 
354 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3872  aminotransferase, class V  29.32 
 
 
371 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417724  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1817  putative aminotransferase  28.69 
 
 
406 aa  139  8.999999999999999e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.372186  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11530  L-aspartate aminotransferase;phosphoserine aminotransferase  26.65 
 
 
384 aa  133  6e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000426602  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1870  Serine--glyoxylate transaminase  31.68 
 
 
389 aa  124  2e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.856595  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  26.36 
 
 
382 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0040  aminotransferase class V  28.1 
 
 
385 aa  120  3e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0119169  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0265  aminotransferase, class V  25.21 
 
 
373 aa  120  4.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000264694  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0977  aminotransferase class V  27.75 
 
 
379 aa  118  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.300897 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1323  alanine--glyoxylate transaminase  26.45 
 
 
387 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1247  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  25.5 
 
 
382 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.465201  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0519  alanine--glyoxylate transaminase  25.79 
 
 
382 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  25.5 
 
 
382 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3486  aminotransferase class V  30.5 
 
 
382 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2630  aminotransferase class V  30.5 
 
 
382 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00351  soluble hydrogenase small subunit  27.99 
 
 
385 aa  113  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4145  Serine--glyoxylate transaminase  29.13 
 
 
395 aa  112  8.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2538  Serine--pyruvate transaminase  26.49 
 
 
413 aa  112  9e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102161  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0835  alanine--glyoxylate transaminase  29.46 
 
 
384 aa  112  9e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.389191  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>