21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1122 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1122  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  100 
 
 		 572 aa  1175    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.371922  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1258  hypothetical protein  32.49 
 
 		 650 aa  216  9.999999999999999e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0023  hypothetical protein  32.59 
 
 		 576 aa  212  2e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.640701  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0796  hypothetical protein  31.4 
 
 		 535 aa  207  5e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1015  hypothetical protein  31.74 
 
 		 701 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.693082  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1612  hypothetical protein  29.59 
 
 		 866 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15742  normal  0.514221 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7054  hypothetical protein  30.32 
 
 		 739 aa  195  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.601581  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2066  hypothetical protein  31.55 
 
 		 636 aa  180  7e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0264  hypothetical protein  29.96 
 
 		 880 aa  176  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.25272  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1348  hypothetical protein  31.81 
 
 		 643 aa  172  1e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1598  hypothetical protein  30.19 
 
 		 521 aa  171  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1539  hypothetical protein  31.41 
 
 		 399 aa  170  6e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2087  AAA ATPase  30.58 
 
 		 685 aa  169  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1199  putative ATP-binding protein  31.07 
 
 		 545 aa  166  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0498844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4450  putative ATP-binding protein  31.07 
 
 		 427 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.403742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4830  putative ATP-binding protein  31.58 
 
 		 525 aa  163  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4916  putative ATP-binding protein  31.82 
 
 		 377 aa  157  6e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.325325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2704  bifunctional DNA primase/polymerase  25.69 
 
 		 746 aa  153  8e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000315845  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3378  hypothetical protein  27.5 
 
 		 317 aa  91.3  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2546  hypothetical protein  24.19 
 
 		 1027 aa  50.1  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000509076  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3497  putative CheA signal transduction histidine kinase  24.52 
 
 		 789 aa  44.3  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>