30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0850 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0850  F0F1-type ATP synthase epsilon subunit-like protein  100 
 
 		 134 aa  271  3e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2329  hypothetical protein  41.67 
 
 		 136 aa  111  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1557  ATP synthase F1, epsilon subunit, putative  37.69 
 
 		 135 aa  84  7e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0417454  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3930  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  45.21 
 
 		 146 aa  63.5  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.6522  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4098  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  43.84 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.000020928  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19680  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.27 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.346073  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2669  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  27.43 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1439  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.04 
 
 		 150 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0420  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.86 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.430144  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0436  ATP synthase F1, epsilon subunit  27.19 
 
 		 136 aa  48.5  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.189637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1955  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.11 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0048  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.83 
 
 		 139 aa  47  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0316883 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1291  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.94 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.50661  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0148  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.94 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.165586  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2651  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.94 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.793575  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2793  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.94 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.984814  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1055  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.94 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0124  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.94 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2774  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.92 
 
 		 153 aa  45.4  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.141891  normal  0.534011 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1056  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.91 
 
 		 139 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3050  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.36 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2990  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  27.68 
 
 		 126 aa  45.1  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.136742  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1660  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.57 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2335  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.32 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0464  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  25.23 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.106743 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1128  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  26.96 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.348126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3105  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.46 
 
 		 139 aa  42  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.200708 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1162  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  27.03 
 
 		 129 aa  40.8  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.169279  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5559  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.04 
 
 		 152 aa  40.4  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0406326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0889  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.25 
 
 		 134 aa  40.4  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.191258  normal  0.156893 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>