30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0192 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0192  hypothetical protein  100 
 
 		 80 aa  166  9e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.77367  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2568  hypothetical protein  56.96 
 
 		 85 aa  97.8  5e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3956  hypothetical protein  51.39 
 
 		 79 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000131135  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2500  hypothetical protein  47.89 
 
 		 85 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00388461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2137  hypothetical protein  46.58 
 
 		 89 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.309843  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0492  hypothetical protein  47.76 
 
 		 97 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.29977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2376  hypothetical protein  41.89 
 
 		 80 aa  65.1  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1329  Protein of unknown function DUF2442  41.89 
 
 		 79 aa  62  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372329  normal  0.118395 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1496  Protein of unknown function DUF2442  35.62 
 
 		 78 aa  58.5  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.367948  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1569  hypothetical protein  40.85 
 
 		 82 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.997179  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2429  hypothetical protein  33.33 
 
 		 110 aa  53.9  0.0000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1097  hypothetical protein  32.86 
 
 		 83 aa  52.8  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0923  hypothetical protein  36.36 
 
 		 91 aa  52.4  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0568  hypothetical protein  33.33 
 
 		 91 aa  51.2  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.145663  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1246  hypothetical protein  30.56 
 
 		 103 aa  49.7  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.388474  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0271  hypothetical protein  33.8 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1018  hypothetical protein  28.77 
 
 		 106 aa  47.8  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0363  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A-like  36.76 
 
 		 90 aa  47.4  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000167862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0240  hypothetical protein  31.25 
 
 		 94 aa  47  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1342  hypothetical protein  32.86 
 
 		 80 aa  46.2  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2540  hypothetical protein  30.56 
 
 		 101 aa  46.2  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1387  hypothetical protein  32.86 
 
 		 80 aa  46.2  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1439  hypothetical protein  30.99 
 
 		 81 aa  45.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.766966  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0617  hypothetical protein  31.51 
 
 		 90 aa  42.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1000  hypothetical protein  30.56 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.130432  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1403  hypothetical protein  27.71 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1285  hypothetical protein  27.71 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4194  hypothetical protein  28.17 
 
 		 95 aa  40.4  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2523  hypothetical protein  27.27 
 
 		 88 aa  40  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009472  Acry_3622  hypothetical protein  30.65 
 
 		 84 aa  40.4  0.009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>