111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1665 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010531  Pnec_1665  protein of unknown function DUF526  100 
 
 
84 aa  167  6e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.553363 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1959  hypothetical protein  91.57 
 
 
85 aa  152  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0196  protein of unknown function DUF526  65.22 
 
 
85 aa  98.6  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.969405  normal  0.608689 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0215  protein of unknown function DUF526  65.22 
 
 
85 aa  97.8  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000337039 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0340  hypothetical protein  61.97 
 
 
87 aa  95.1  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0238  hypothetical protein  60.56 
 
 
85 aa  94.7  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0289  hypothetical protein  62.32 
 
 
115 aa  94  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0650  hypothetical protein  48.75 
 
 
201 aa  89.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.594144  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3219  hypothetical protein  46.43 
 
 
83 aa  87.4  6e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0569358  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0194  hypothetical protein  46.43 
 
 
83 aa  87.4  6e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.297291  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1399  hypothetical protein  46.43 
 
 
83 aa  87.4  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0486  hypothetical protein  46.43 
 
 
83 aa  87.4  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.139872  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2826  hypothetical protein  46.43 
 
 
83 aa  87.4  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.865943  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0436  hypothetical protein  46.43 
 
 
83 aa  86.7  9e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6196  hypothetical protein  46.43 
 
 
83 aa  86.7  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2253  hypothetical protein  46.43 
 
 
83 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0117  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2922  hypothetical protein  46.43 
 
 
83 aa  86.7  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.110016  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2867  hypothetical protein  46.43 
 
 
83 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00166456  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2878  hypothetical protein  46.43 
 
 
83 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.794301 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2784  hypothetical protein  46.43 
 
 
83 aa  86.7  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.79005  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0406  hypothetical protein  47.5 
 
 
201 aa  85.1  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.607195  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0467  hypothetical protein  45.24 
 
 
83 aa  85.1  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.556886  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0255  hypothetical protein  46.43 
 
 
84 aa  84.3  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0524  protein of unknown function DUF526  42.86 
 
 
84 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4191  hypothetical protein  41.67 
 
 
84 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.975481 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0051  hypothetical protein  58.73 
 
 
80 aa  75.1  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0461056  normal  0.538804 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0125  hypothetical protein  49.3 
 
 
100 aa  73.2  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0238  hypothetical protein  46.38 
 
 
87 aa  68.2  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.269787  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0596  protein of unknown function DUF526  50 
 
 
83 aa  68.2  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.60187  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2124  hypothetical protein  48 
 
 
81 aa  64.7  0.0000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.112916  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0060  hypothetical protein  45.21 
 
 
81 aa  63.5  0.0000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2392  protein of unknown function DUF526  42.11 
 
 
87 aa  62.4  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2405  hypothetical protein  58.82 
 
 
91 aa  62  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69820  hypothetical protein  54.55 
 
 
86 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.240173 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0201  hypothetical protein  44.74 
 
 
83 aa  60.5  0.000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3099  hypothetical protein  47.14 
 
 
95 aa  60.5  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0191  hypothetical protein  41.67 
 
 
91 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2004  hypothetical protein  54.72 
 
 
99 aa  59.3  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5507  hypothetical protein  42.68 
 
 
86 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.754805  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0258  hypothetical protein  42.68 
 
 
115 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6031  hypothetical protein  54.55 
 
 
86 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00075  hypothetical protein  41.1 
 
 
83 aa  58.9  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0215  hypothetical protein  42.68 
 
 
93 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.739571  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2511  hypothetical protein  39.39 
 
 
80 aa  57.8  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.207429  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47800  hypothetical protein  50.94 
 
 
91 aa  57.4  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0117434  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5235  hypothetical protein  39.02 
 
 
88 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.517993  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5144  hypothetical protein  39.02 
 
 
133 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0151  protein of unknown function DUF526  37.68 
 
 
84 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.279518 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3773  protein of unknown function DUF526  44 
 
 
83 aa  55.1  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.764723 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0237  hypothetical protein  41.46 
 
 
87 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.186127  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5296  hypothetical protein  50.94 
 
 
105 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03656  hypothetical protein  41.1 
 
 
92 aa  53.9  0.0000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.854851  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3160  hypothetical protein  36.99 
 
 
118 aa  53.5  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0552174  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0081  hypothetical protein  52.17 
 
 
104 aa  53.5  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.261842  normal  0.96148 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3655  hypothetical protein  51.85 
 
 
79 aa  52.4  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2020  protein of unknown function DUF526  34.72 
 
 
87 aa  52.8  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.271189  normal  0.774588 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3264  protein of unknown function DUF526  38.36 
 
 
94 aa  52.4  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00236527  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2390  hypothetical protein  34.72 
 
 
87 aa  52.8  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3186  protein of unknown function DUF526  40.28 
 
 
94 aa  52  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0950653  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3271  hypothetical protein  39.19 
 
 
85 aa  51.6  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0356  hypothetical protein  51.92 
 
 
84 aa  51.2  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0566  hypothetical protein  36.99 
 
 
93 aa  50.8  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0290  hypothetical protein  36.99 
 
 
93 aa  50.8  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0647  hypothetical protein  36.99 
 
 
93 aa  50.8  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3455  putative cytoplasmic protein  36.99 
 
 
99 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3448  hypothetical protein  36.99 
 
 
98 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3380  hypothetical protein  36.99 
 
 
98 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3550  hypothetical protein  36.99 
 
 
98 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.117116  normal  0.856827 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0304  hypothetical protein  40.28 
 
 
86 aa  50.4  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02914  hypothetical protein  35.62 
 
 
96 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0658  protein of unknown function DUF526  35.62 
 
 
96 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02864  hypothetical protein  35.62 
 
 
96 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3220  hypothetical protein  35.62 
 
 
116 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000279177  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0655  hypothetical protein  35.62 
 
 
96 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.601342 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0375  hypothetical protein  40 
 
 
84 aa  50.4  0.000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3651  hypothetical protein  40 
 
 
84 aa  50.4  0.000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0370  hypothetical protein  40 
 
 
84 aa  50.4  0.000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3385  hypothetical protein  36.99 
 
 
98 aa  50.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0641  hypothetical protein  46.15 
 
 
86 aa  49.7  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0069  hypothetical protein  41.43 
 
 
83 aa  50.1  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0427  hypothetical protein  39.19 
 
 
83 aa  50.1  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3340  hypothetical protein  35.62 
 
 
119 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.605641  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3479  hypothetical protein  35.62 
 
 
116 aa  49.7  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000424382  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4329  hypothetical protein  38.67 
 
 
84 aa  49.3  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0625  hypothetical protein  47.83 
 
 
84 aa  49.3  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0405  hypothetical protein  50.94 
 
 
84 aa  49.3  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3507  hypothetical protein  35.62 
 
 
116 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00191657  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4151  hypothetical protein  39.73 
 
 
86 aa  49.3  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0464  hypothetical protein  37.33 
 
 
88 aa  49.3  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0524  hypothetical protein  39.76 
 
 
83 aa  48.1  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.220211  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4287  hypothetical protein  34.25 
 
 
92 aa  48.1  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4357  hypothetical protein  35.62 
 
 
99 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000509229  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0301  hypothetical protein  34.67 
 
 
83 aa  47.8  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3454  hypothetical protein  34.25 
 
 
98 aa  47.8  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0826655 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3600  hypothetical protein  37.33 
 
 
85 aa  47.8  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4013  hypothetical protein  48.15 
 
 
84 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3991  hypothetical protein  48.15 
 
 
84 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4107  hypothetical protein  48.15 
 
 
84 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3914  protein of unknown function DUF526  48.15 
 
 
84 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0858  hypothetical protein  32.89 
 
 
97 aa  46.6  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>