26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4643 on replicon NC_008760
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008760  Pnap_4643  hypothetical protein  100 
 
 		 80 aa  163  8e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.777081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4842  hypothetical protein  55.17 
 
 		 445 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4729  hypothetical protein  55.17 
 
 		 445 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.199919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1752  hypothetical protein  55.17 
 
 		 445 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.227885  normal  0.59787 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2981  hypothetical protein  50 
 
 		 219 aa  68.6  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4752  hypothetical protein  56.9 
 
 		 441 aa  67  0.00000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.839178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4825  hypothetical protein  56.9 
 
 		 441 aa  67  0.00000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4481  hypothetical protein  56.9 
 
 		 441 aa  66.2  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.579978  hitchhiker  0.0000396419 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2215  transposase, IS4 family protein  57.69 
 
 		 439 aa  65.1  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.501331  normal  0.787142 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3660  transposase, IS4 family protein  57.69 
 
 		 439 aa  65.1  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3105  transposase, IS4 family protein  57.69 
 
 		 439 aa  65.1  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0428603 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2775  transposase, IS4 family protein  57.69 
 
 		 439 aa  65.1  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0055865 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3113  hypothetical protein  55.17 
 
 		 293 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5887  transposase IS4 family protein  49.06 
 
 		 481 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000153597 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41930  transposase  43.64 
 
 		 234 aa  51.2  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.209589  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31320  transposase  43.64 
 
 		 460 aa  50.8  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0165  IS4 family transposase  50 
 
 		 212 aa  50.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0055531  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2199  transposase Tn5  47.73 
 
 		 467 aa  50.4  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.334008  hitchhiker  0.00000000355698 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2515  transposase IS4 family protein  47.73 
 
 		 467 aa  50.1  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.99983  normal  0.0630319 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18270  transposase  47.5 
 
 		 460 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18340  transposase  47.5 
 
 		 460 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.308708  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12240  transposase  47.5 
 
 		 460 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33340  transposase  47.5 
 
 		 460 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3107  transposase, IS4 family protein  55.26 
 
 		 419 aa  42.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0395714 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4034  hypothetical protein  38.46 
 
 		 470 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.287551 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4025  hypothetical protein  38.46 
 
 		 470 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>