18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3836 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3836  putative p-cresol methylhydroxylase subunit  100 
 
 		 106 aa  218  1.9999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1842  hypothetical protein  54.17 
 
 		 119 aa  82.8  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.587463  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1477  cytochrome c, class I  42.7 
 
 		 108 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.223855  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2961  cytochrome c, class I  49.23 
 
 		 108 aa  70.5  0.000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.428474  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2408  cytochrome c, class I  44.58 
 
 		 117 aa  69.3  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3478  hypothetical protein  48.53 
 
 		 113 aa  66.6  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1651  hypothetical protein  36.36 
 
 		 109 aa  61.2  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4390  hypothetical protein  39.71 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828991 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3925  cytochrome c, class I  34.04 
 
 		 975 aa  48.5  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.073446 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1855  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  31.91 
 
 		 996 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1211  hypothetical protein  32.53 
 
 		 121 aa  45.4  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000024184  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2123  hypothetical protein  36.44 
 
 		 132 aa  45.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0190  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  32.58 
 
 		 1253 aa  45.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4058  isoquinoline 1-oxidoreductase  32.26 
 
 		 1215 aa  44.7  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.222777 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3062  hypothetical protein  31.33 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5018  nitrite reductase (NO-forming)  36.36 
 
 		 503 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0942  cytochrome c class I  34.29 
 
 		 329 aa  42  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.240089 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3862  cytochrome c class I  34.25 
 
 		 111 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>