17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3497 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_3497  hypothetical protein  100 
 
 
268 aa  550  1e-156  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.798864 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4026  hypothetical protein  78.99 
 
 
257 aa  407  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.452989  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3530  hypothetical protein  71.98 
 
 
258 aa  385  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.475769  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0824  hypothetical protein  70.99 
 
 
261 aa  340  1e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0348  hypothetical protein  57.25 
 
 
280 aa  296  2e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4168  hypothetical protein  56.81 
 
 
258 aa  251  7e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.106721 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0670  hypothetical protein  37.91 
 
 
251 aa  100  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0896  hypothetical protein  26.57 
 
 
320 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57640  hypothetical protein  27.27 
 
 
320 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.842673 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5009  hypothetical protein  27.27 
 
 
320 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.26396  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1076  hypothetical protein  33.65 
 
 
230 aa  82.4  0.000000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0875  hypothetical protein  32.98 
 
 
231 aa  72.8  0.000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.168274  normal  0.978348 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0434  hypothetical protein  28.44 
 
 
274 aa  63.9  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1523  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.12 
 
 
245 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.52918  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1618  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.07 
 
 
245 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.127216  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2346  TPR repeat-containing protein  33.12 
 
 
244 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  26.79 
 
 
542 aa  42.4  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>