27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1528 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1528  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 107 aa  216  8.999999999999998e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3120  putative transcriptional regulator  92.16 
 
 		 107 aa  192  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0075021  normal  0.180211 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2054  putative transcriptional regulator  74 
 
 		 105 aa  160  5.0000000000000005e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.295818  normal  0.220655 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1715  transcriptional regulator protein-like protein  77 
 
 		 154 aa  159  9e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.118442  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2492  putative transcriptional regulator  74 
 
 		 101 aa  159  1e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.298845  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1972  putative transcriptional regulator  77 
 
 		 103 aa  159  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000001755  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3145  putative transcriptional regulator  74 
 
 		 101 aa  159  1e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.534496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5059  putative transcriptional regulator  73 
 
 		 101 aa  156  8e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306977 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1388  putative transcriptional regulator  77.66 
 
 		 111 aa  155  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.682529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1054  HxlR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2404  HxlR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 113 aa  68.2  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.598252  normal  0.595258 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0961  putative transcriptional regulator  40.86 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1763  helix-turn-helix, HxlR type  34.74 
 
 		 113 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.168632  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3596  putative transcriptional regulator  37.63 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0219854  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5094  HxlR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 115 aa  57  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.709504  normal  0.631599 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6227  transcriptional regulator, HxlR family  40.7 
 
 		 107 aa  53.9  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56146  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1315  HxlR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 163 aa  52  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.9488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7489  transcriptional regulator, HxlR family  33.72 
 
 		 100 aa  50.4  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2190  putative transcriptional regulator  28.43 
 
 		 119 aa  48.1  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000426745  normal  0.636756 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02250  predicted transcriptional regulator  28.89 
 
 		 110 aa  46.2  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1290  transcriptional regulator, HxlR family  34.52 
 
 		 134 aa  45.4  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1522  hypothetical protein  24.78 
 
 		 126 aa  43.9  0.0006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.181711  normal  0.471635 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1635  transcriptional regulator, HxlR family  29.33 
 
 		 119 aa  44.3  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.168086  normal  0.505832 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0271  transcriptional regulator, HxlR family  28.43 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1273  HxlR family transcriptional regulator  28 
 
 		 106 aa  42  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.866565  hitchhiker  0.0000000994853 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2241  HxlR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 119 aa  41.6  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.306938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1661  HxlR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 130 aa  41.6  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>