24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1252 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1252  hypothetical protein  100 
 
 		 137 aa  261  2e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.856348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4515  hypothetical protein  73.38 
 
 		 154 aa  179  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.39574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0421  hypothetical protein  71.43 
 
 		 160 aa  155  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4537  hypothetical protein  75 
 
 		 148 aa  147  6e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0043  hypothetical protein  49.26 
 
 		 128 aa  85.9  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2715  hypothetical protein  53.98 
 
 		 162 aa  76.6  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000424232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2195  hypothetical protein  65.33 
 
 		 159 aa  74.7  0.0000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1173  hypothetical protein  54.95 
 
 		 157 aa  70.5  0.000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.803262  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5391  hypothetical protein  46.15 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0468247 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0027  hypothetical protein  58.97 
 
 		 151 aa  62  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.785237  hitchhiker  0.000412505 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0028  hypothetical protein  58.97 
 
 		 151 aa  62  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.897017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0026  hypothetical protein  58.97 
 
 		 151 aa  62  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.894547 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1464  hypothetical protein  46.81 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0147  hypothetical protein  49.66 
 
 		 147 aa  57  0.00000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1643  hypothetical protein  41.35 
 
 		 161 aa  55.1  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.139577 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1229  hypothetical protein  31.78 
 
 		 161 aa  52.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.163655  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6192  hypothetical protein  39.08 
 
 		 155 aa  51.6  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4498  hypothetical protein  36.04 
 
 		 156 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0225753  normal  0.0328772 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4365  hypothetical protein  36.04 
 
 		 156 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.19784  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2327  hypothetical protein  37.38 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6331  hypothetical protein  32.56 
 
 		 165 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.305549 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1652  hypothetical protein  58.33 
 
 		 166 aa  41.6  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106232  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5292  hypothetical protein  58.33 
 
 		 166 aa  41.6  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0649  hypothetical protein  46.51 
 
 		 177 aa  40  0.01  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.514048 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>