62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0959 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0959  putative lipoprotein  100 
 
 		 170 aa  352  1e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0908  putative lipoprotein  85.71 
 
 		 173 aa  298  2e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4089  putative lipoprotein  61.59 
 
 		 157 aa  213  8e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3490  putative lipoprotein  59.04 
 
 		 166 aa  199  1.9999999999999998e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.212629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2813  putative lipoprotein  58.43 
 
 		 166 aa  198  3e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.205261  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1840  putative lipoprotein  60.9 
 
 		 165 aa  187  5.999999999999999e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0582073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3837  hypothetical protein  59.48 
 
 		 189 aa  179  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.139182  normal  0.877225 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2382  lipoprotein  35.83 
 
 		 180 aa  124  6e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.335276  normal  0.0101048 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2770  hypothetical protein  35.79 
 
 		 200 aa  123  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.172738  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2191  lipoprotein  36.17 
 
 		 180 aa  122  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.768986  normal  0.0760523 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0604  lipoprotein  42.24 
 
 		 163 aa  119  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0673  lipoprotein  35.26 
 
 		 182 aa  117  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2595  putative lipoprotein  35.11 
 
 		 180 aa  114  6e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.154959 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1552  putative lipoprotein  34.78 
 
 		 183 aa  95.5  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1794  putative lipoprotein  35.43 
 
 		 193 aa  95.5  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.568461 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1174  hypothetical protein  34.81 
 
 		 202 aa  92.8  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.496107  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2130  hypothetical protein  39.16 
 
 		 185 aa  93.2  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.188656  normal  0.657299 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0695  hypothetical protein  34.81 
 
 		 202 aa  92.8  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.127782  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1150  hypothetical protein  34.81 
 
 		 184 aa  92.8  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.35893 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4286  hypothetical protein  34.62 
 
 		 185 aa  92.8  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2854  putative lipoprotein  38.36 
 
 		 269 aa  92.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1056  hypothetical protein  34.62 
 
 		 185 aa  92  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2929  putative lipoprotein  33.7 
 
 		 183 aa  92  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.251431 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1770  putative lipoprotein  38.46 
 
 		 184 aa  91.3  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2793  putative lipoprotein  38.36 
 
 		 196 aa  91.3  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.571762  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2734  putative lipoprotein  38.36 
 
 		 196 aa  91.3  6e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1053  hypothetical protein  36.99 
 
 		 174 aa  89.4  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521655  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0047  hypothetical protein  37.5 
 
 		 164 aa  89.4  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.3876 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3111  hypothetical protein  34 
 
 		 168 aa  64.7  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0268  putative lipoprotein transmembrane  39.18 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2071  hypothetical protein  31.4 
 
 		 173 aa  54.3  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0605  hypothetical protein  30.5 
 
 		 207 aa  53.9  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1356  hypothetical protein  31.43 
 
 		 172 aa  53.9  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3222  putative lipoprotein  28.47 
 
 		 183 aa  51.2  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.790276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6448  putative lipoprotein  27.81 
 
 		 168 aa  50.8  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.961477  normal  0.265781 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1899  hypothetical protein  30.08 
 
 		 201 aa  50.8  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.288907  normal  0.292321 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1336  putative lipoprotein  28.47 
 
 		 183 aa  50.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.130729  normal  0.043389 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4094  hypothetical protein  30.85 
 
 		 178 aa  50.4  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2222  putative transmembrane protein  29.27 
 
 		 150 aa  50.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.605647 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2016  putative lipoprotein  25 
 
 		 174 aa  48.1  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0546155  normal  0.543739 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4689  putative lipoprotein transmembrane  30.77 
 
 		 167 aa  47  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0388  putative lipoprotein transmembrane  30.89 
 
 		 164 aa  45.1  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0886076 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1121  putative lipoprotein  25.2 
 
 		 166 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0404  putative lipoprotein  25.2 
 
 		 166 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1289  putative lipoprotein  25.2 
 
 		 166 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.511578  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1282  putative lipoprotein  25.2 
 
 		 166 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0745  putative lipoprotein  25.2 
 
 		 166 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5584  hypothetical protein  25 
 
 		 170 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.60834  normal  0.68228 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1021  hypothetical protein  24.26 
 
 		 170 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.704732 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1838  putative lipoprotein  25.2 
 
 		 170 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1480  lipoprotein transmembrane  28.46 
 
 		 177 aa  43.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.028098  normal  0.441465 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1427  putative lipoprotein  25.2 
 
 		 179 aa  43.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2173  hypothetical protein  24.19 
 
 		 170 aa  42  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2280  hypothetical protein  24.19 
 
 		 170 aa  42  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282799  normal  0.210779 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2256  hypothetical protein  24.19 
 
 		 170 aa  42  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1644  hypothetical protein  24.19 
 
 		 170 aa  42  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2294  hypothetical protein  24.19 
 
 		 170 aa  42  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.075396  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0919  hypothetical protein  24.31 
 
 		 177 aa  41.6  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.600843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1374  putative lipoprotein transmembrane  26.19 
 
 		 172 aa  41.2  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.399659  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1053  putative lipoprotein  24.37 
 
 		 216 aa  41.2  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000833656  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4572  putative transmembrane protein  26.98 
 
 		 173 aa  40.8  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.686255  normal  0.728328 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3500  hypothetical protein  26.98 
 
 		 173 aa  40.8  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0357475  normal  0.416536 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>