40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0704 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0704  putative transmembrane protein  100 
 
 		 126 aa  244  3e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.231746  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1178  putative transmembrane protein  73.39 
 
 		 129 aa  188  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0741  putative transmembrane protein  71.88 
 
 		 128 aa  185  2e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0778968  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0778  putative transmembrane protein  71.09 
 
 		 128 aa  184  3e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0313812 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1050  putative transmembrane protein  69.84 
 
 		 128 aa  171  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0839  hypothetical protein  67.2 
 
 		 125 aa  167  4e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5551  putative transmembrane protein  68.22 
 
 		 130 aa  162  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.272582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2954  putative transmembrane protein  63.72 
 
 		 138 aa  148  3e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.576571  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1218  transmembrane protein  33.62 
 
 		 118 aa  67.8  0.00000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3102  transmembrane protein  36.36 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.766019  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2984  hypothetical protein  33.62 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2756  hypothetical protein  32.76 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3715  hypothetical protein  32.76 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3657  hypothetical protein  32.76 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1797  hypothetical protein  32.76 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3248  hypothetical protein  32.76 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2705  hypothetical protein  32.76 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3684  hypothetical protein  32.76 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0434  membrane protein  31.9 
 
 		 130 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.455263  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2673  membrane protein  31.9 
 
 		 130 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.766452  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0413  membrane protein  31.9 
 
 		 130 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0113586 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0352  membrane protein  31.86 
 
 		 130 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0361  membrane protein  31.86 
 
 		 130 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.485952 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2838  membrane protein-like  38.46 
 
 		 122 aa  52.8  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3532  membrane protein  35 
 
 		 130 aa  51.2  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22213  normal  0.443182 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2483  transmembrane protein  32.2 
 
 		 122 aa  51.2  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.226347 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3239  hypothetical protein  31.03 
 
 		 130 aa  50.8  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0677  hypothetical protein  29.73 
 
 		 134 aa  47.4  0.00007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0407  hypothetical protein  34.82 
 
 		 131 aa  46.2  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4291  hypothetical protein  34.48 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3551  hypothetical protein  36.45 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0392282  hitchhiker  0.000178904 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0963  membrane protein-like protein  28.69 
 
 		 122 aa  45.1  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.186902  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0337  membrane protein  35.14 
 
 		 130 aa  45.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.173405  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2943  hypothetical protein  35.51 
 
 		 124 aa  44.3  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1100  putative transmembrane protein  25 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.664506  normal  0.414294 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3220  putative transmembrane protein  34.11 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.300525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0419  hypothetical protein  30 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0644826 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2873  hypothetical protein  35.51 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0329049 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0812  membrane protein-like  36.36 
 
 		 139 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2750  hypothetical protein  35.71 
 
 		 131 aa  41.6  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>