10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0868 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0868  DNA polymerase III delta  100 
 
 
327 aa  652    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0767  DNA polymerase III, delta subunit  29.94 
 
 
324 aa  123  5e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.844156  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0743  DNA polymerase III, delta subunit  29.64 
 
 
324 aa  122  9e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0670  DNA polymerase III delta  27.16 
 
 
320 aa  120  3.9999999999999996e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.840892  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1151  DNA polymerase III, delta  30.38 
 
 
316 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5512  DNA polymerase III, delta subunit  26.01 
 
 
318 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.504789 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3538  DNA polymerase III subunit delta  28.46 
 
 
328 aa  45.8  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.332998  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3469  DNA polymerase III subunit delta  37.04 
 
 
329 aa  44.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.206269  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  23.11 
 
 
331 aa  45.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1733  DNA polymerase III, delta subunit  21.95 
 
 
338 aa  42.7  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>