16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3671 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3671  hypothetical protein  100 
 
 		 86 aa  167  4e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4717  hypothetical protein  69.77 
 
 		 86 aa  120  5e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.813959  normal  0.441756 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0799  hypothetical protein  69.77 
 
 		 86 aa  118  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.829636 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4431  hypothetical protein  70.93 
 
 		 86 aa  117  6e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0785  hypothetical protein  69.77 
 
 		 86 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0982  hypothetical protein  63.95 
 
 		 86 aa  111  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0283984  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1142  hypothetical protein  59.3 
 
 		 86 aa  102  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0991751  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61340  hypothetical protein  66.67 
 
 		 87 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.422961 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5282  hypothetical protein  65.52 
 
 		 87 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.587744  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1068  hypothetical protein  50 
 
 		 264 aa  73.6  0.0000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.697247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2164  hypothetical protein  44.12 
 
 		 74 aa  55.1  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1715  hypothetical protein  35.62 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.825989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0775  hypothetical protein  38.81 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.185794 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2431  hypothetical protein  34.67 
 
 		 104 aa  41.6  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.642772  normal  0.0866494 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1474  hypothetical protein  39.44 
 
 		 105 aa  41.2  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0666349  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0683  hypothetical protein  29.85 
 
 		 87 aa  40.4  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.740334  normal  0.446844 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>