37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1789 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1789  hypothetical protein  100 
 
 		 364 aa  733    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.651057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1412  hypothetical protein  65.35 
 
 		 358 aa  504  9.999999999999999e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3903  hypothetical protein  63.53 
 
 		 356 aa  487  1e-136  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1582  hypothetical protein  64.39 
 
 		 355 aa  483  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.422595  normal  0.277534 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29120  hypothetical protein  66.57 
 
 		 361 aa  474  1e-132  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00446947 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3985  hypothetical protein  65.74 
 
 		 361 aa  464  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.315148  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1317  hypothetical protein  64.53 
 
 		 357 aa  448  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.828005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3872  hypothetical protein  64.25 
 
 		 357 aa  448  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.286953  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4572  hypothetical protein  64.25 
 
 		 357 aa  448  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4093  hypothetical protein  63.41 
 
 		 357 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1600  hypothetical protein  40.84 
 
 		 357 aa  275  1.0000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.867208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3749  hypothetical protein  38.15 
 
 		 379 aa  241  1e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4190  hypothetical protein  36.06 
 
 		 395 aa  223  4e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03982  hypothetical protein  31.01 
 
 		 369 aa  213  2.9999999999999995e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.47471  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2262  hypothetical protein  31.75 
 
 		 413 aa  186  5e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.279668  normal  0.10352 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5355  hypothetical protein  31.16 
 
 		 393 aa  186  6e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12788  hypothetical protein  29.38 
 
 		 401 aa  176  5e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.405764  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4139  hypothetical protein  28.01 
 
 		 376 aa  172  1e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.153344  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0375  hypothetical protein  27.75 
 
 		 382 aa  168  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0193  hypothetical protein  24.54 
 
 		 397 aa  117  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0142  hypothetical protein  32.58 
 
 		 541 aa  112  9e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0125  hypothetical protein  33.51 
 
 		 541 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1873  hypothetical protein  25.61 
 
 		 385 aa  92  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.146136  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1794  hypothetical protein  25.34 
 
 		 385 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.400536  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2083  hypothetical protein  23.84 
 
 		 385 aa  73.9  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.213207  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1745  hypothetical protein  24.7 
 
 		 384 aa  70.5  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.886322  normal  0.285515 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1599  hypothetical protein  20.66 
 
 		 1124 aa  53.5  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0273  hypothetical protein  23.42 
 
 		 1098 aa  47  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4482  hypothetical protein  18.67 
 
 		 1002 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4173  hypothetical protein  18.9 
 
 		 1009 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1354  protein of unknown function DUF748  22.56 
 
 		 1428 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4569  hypothetical protein  16.59 
 
 		 978 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.280096 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4704  hypothetical protein  16.59 
 
 		 978 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.542548  hitchhiker  0.00128014 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2712  hypothetical protein  23.83 
 
 		 595 aa  43.1  0.008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0729  hypothetical protein  17.02 
 
 		 978 aa  42.7  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0010551 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42760  hypothetical protein  18.25 
 
 		 981 aa  42.7  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1259  hypothetical protein  21.28 
 
 		 996 aa  42.7  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>