15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1822 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1822  hypothetical protein  100 
 
 
242 aa  498  1e-140  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0401473  normal  0.904064 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1409  protein of unknown function DUF955  48.04 
 
 
383 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03130  predicted Zn peptidase  47.7 
 
 
387 aa  165  6.9999999999999995e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.105125  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3552  hypothetical protein  45.14 
 
 
385 aa  162  5.0000000000000005e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2482  protein of unknown function DUF955  41.42 
 
 
383 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2477  protein of unknown function DUF955  42.6 
 
 
384 aa  120  9.999999999999999e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.204932  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1505  hypothetical protein  40.83 
 
 
383 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0275  DNA-binding protein  36.31 
 
 
377 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0309  hypothetical protein  27.91 
 
 
392 aa  76.3  0.0000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6169  protein of unknown function DUF955  29.24 
 
 
392 aa  73.2  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1309  hypothetical protein  34.71 
 
 
284 aa  70.1  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.584713  normal  0.697402 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3252  hypothetical protein  32.35 
 
 
376 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2518  protein of unknown function DUF955  28.1 
 
 
378 aa  63.2  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.010681 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1747  protein of unknown function DUF955  25.7 
 
 
381 aa  57  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124074  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12537  hypothetical protein  28.43 
 
 
415 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.9395e-37  hitchhiker  0.00258051 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>