20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1573 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1573  hypothetical protein  100 
 
 
418 aa  840    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00652866 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2775  hypothetical protein  57.46 
 
 
412 aa  484  1e-135  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.717789  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1807  hypothetical protein  57.78 
 
 
411 aa  478  1e-134  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0398  hypothetical protein  53.16 
 
 
410 aa  426  1e-118  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0194907  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1682  hypothetical protein  53.23 
 
 
422 aa  414  1e-114  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.246991  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1845  hypothetical protein  50.87 
 
 
411 aa  399  9.999999999999999e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0652  hypothetical protein  46.77 
 
 
411 aa  380  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.828544  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2045  hypothetical protein  48.75 
 
 
408 aa  376  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.107819  normal  0.27128 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1102  hypothetical protein  28.39 
 
 
404 aa  171  3e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1818  hypothetical protein  33.79 
 
 
238 aa  102  1e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0814  LigA  37.8 
 
 
557 aa  53.5  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0862  LigA  37.8 
 
 
544 aa  53.5  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0866  LigA  37.8 
 
 
542 aa  53.5  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2074  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis-like protein  41.18 
 
 
336 aa  48.5  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2071  cytochrome c assembly protein  37.31 
 
 
883 aa  46.2  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.183227 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0708  cytochrome c assembly protein  30.26 
 
 
791 aa  46.2  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1760  cytochrome c assembly protein  24.71 
 
 
889 aa  44.7  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.790958  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1683  cytochrome c assembly protein  31.76 
 
 
760 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00910499  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1754  cytochrome c assembly protein  31.76 
 
 
748 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.133127  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1875  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  28.95 
 
 
873 aa  43.9  0.006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0577395  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>