299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_R0051 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_R0051  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  167  5e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0032  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 84 bp  111  3e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.148891  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0031  tRNA-Leu  93.48 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00794076  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0033  tRNA-Leu  93.48 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000241168  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6050  tRNA-Leu  93.48 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.981043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0002  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 87 bp  65.9  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0012  tRNA-Leu  84.52 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.145187 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0007  tRNA-Leu  84.52 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0003  tRNA-Leu  84.52 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0005  tRNA-Leu  93.18 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.886135  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0049  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0102657  normal  0.539349 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0050  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0025278  normal  0.537231 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0045  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0052  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 89 bp  60  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  91.11 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.1151  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0035  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 88 bp  58  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0033  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 90 bp  58  0.0000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.37116 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0045  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 89 bp  58  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.259532  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0054  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000628501  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0035  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0610176  normal  0.497384 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna27  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0020  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.424906  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0022  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0076  tRNA-Leu  96.88 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000528748  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA2  tRNA-Leu  83.33 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.839683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna19  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.320912  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0003    89.36 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0032  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000644155  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0003  tRNA-Leu  89.36 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.426461  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0057  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 90 bp  54  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000872679  normal  0.444657 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00069  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000211563  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00084  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0537561  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00085  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0537561  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00086  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0554728  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0079  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0203589  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0080  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.02179  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0081  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0210398  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0105  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  3.72191e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3045  hypothetical protein  84.29 
 
 		 98 bp  52  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt43  tRNA-Leu  84.29 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt43  tRNA-Leu  84.29 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4917  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000963852  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0010  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000415832  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4910  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00037453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4958  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  3.4843e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0006  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000413572  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4262  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000100431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4916  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000645766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0122  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000057209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4159  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000704733  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0076  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0048  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4213  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000788892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0030  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.311664 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4957  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  3.4843e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4956  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  3.62786e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0096  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0439108  hitchhiker  0.000125636 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4963  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000169309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4144  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000000390676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0005  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00000679583  normal  0.379222 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0094  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0443375  hitchhiker  0.00012272 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4321  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000341532  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0075  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4161  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000230562  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0047  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000366727  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4876  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000008654  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4915  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000252066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4163  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000000225021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0095  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0436868  hitchhiker  0.00012272 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4727  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000238011  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0006  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0789376  normal  0.851363 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4967  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000670615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4909  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0000511296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4729  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000255517  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4728  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000212107  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4712  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  5.855369999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5234  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000000900844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5113  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164855  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0005  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000329783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5115  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000149408  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5089  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000441658  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4911  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000387587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0029  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.322054 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0033  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.544414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4961  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000179002  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0068  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4962  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000175711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5882  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.119438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0016  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00811405  normal  0.0178437 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0016  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0028  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.324618 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0003  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.172421  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4807  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000360062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0074  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0069  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4808  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000052486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4874  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000096251  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0019  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.531024  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5232  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000000856484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4875  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000898834  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>