23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_R0050 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_R0050  tRNA-Cys  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0070  tRNA-Cys  86.11 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00415694  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0049  tRNA-Cys  89.66 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00399086  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0034  tRNA-His  96.55 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00144339  normal  0.0310402 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0093  tRNA-Cys  87.72 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000139562  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0001  tRNA-His  96.55 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.691209  normal  0.382494 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0036  tRNA-His  96.55 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.34645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0027  tRNA-Cys  84.72 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000465456  normal  0.0215874 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07200  tRNA-Cys  96.43 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000170104  normal  0.867766 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0016  tRNA-Cys  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000139596  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNACysVIMSS1309136  tRNA-Cys  88.24 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0023  tRNA-Cys  88.24 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0036  tRNA-Cys  88.24 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0602009  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0013  tRNA-Cys  88.24 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.279847 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0041  tRNA-Cys  88.24 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.73706  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNACysVIMSS1309369  tRNA-Cys  88.24 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNACysVIMSS1309177  tRNA-Cys  88.24 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNACysVIMSS1309280  tRNA-Cys  88.24 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNACysVIMSS1309216  tRNA-Cys  88.24 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.126677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNACysVIMSS1309104  tRNA-Cys  88.24 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.200833  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0031  tRNA-Cys  87.93 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000393185  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0015  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0118256  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0023  tRNA-Val  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.494525  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>