15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_R0016 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_R0016  tRNA-Cys  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000139596  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0031  tRNA-Cys  88.16 
 
 
75 bp  71.9  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000393185  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0049  tRNA-Cys  86.84 
 
 
75 bp  63.9  0.000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00399086  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0093  tRNA-Cys  96.67 
 
 
74 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000139562  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0104  tRNA-Cys  96.67 
 
 
74 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.916479  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0018  tRNA-Cys  96.67 
 
 
75 bp  52  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0051  tRNA-Cys  96.55 
 
 
74 bp  50.1  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0059  tRNA-Cys  93.75 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000068081  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0026  tRNA-Cys  84.21 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0050  tRNA-Cys  87.5 
 
 
72 bp  48.1  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0026  tRNA-Cys  96.15 
 
 
71 bp  44.1  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0017  tRNA-Phe  96.15 
 
 
73 bp  44.1  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0754329  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0020  tRNA-Cys  96.15 
 
 
71 bp  44.1  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2243  tRNA-Cys  93.33 
 
 
74 bp  44.1  0.005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2329  tRNA-Cys  93.33 
 
 
74 bp  44.1  0.005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00581187  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>