14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3082 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_3082  hypothetical protein  100 
 
 
211 aa  428  1e-119  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0599  hypothetical protein  61.5 
 
 
205 aa  267  1e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1233  hypothetical protein  61.5 
 
 
205 aa  267  1e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.548904 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1154  hypothetical protein  58.77 
 
 
211 aa  258  6e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1122  hypothetical protein  31.84 
 
 
191 aa  94.4  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2109  hypothetical protein  29.72 
 
 
199 aa  65.5  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2211  hypothetical protein  24.86 
 
 
202 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.631963  normal  0.769285 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0556  hypothetical protein  25.42 
 
 
196 aa  52.4  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2495  hypothetical protein  26.92 
 
 
188 aa  51.2  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1297  hypothetical protein  23.39 
 
 
179 aa  50.1  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.202094  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1893  hypothetical protein  22.81 
 
 
192 aa  46.6  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0786568  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1610  hypothetical protein  23.16 
 
 
203 aa  46.6  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.591771  normal  0.0598234 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1681  hypothetical protein  24.29 
 
 
196 aa  45.8  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000644612 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2290  hypothetical protein  24.46 
 
 
191 aa  42.7  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>