10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0875 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0875  Flp/Fap pilin component  100 
 
 		 57 aa  117  4.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0798  Flp/Fap pilin component  59.57 
 
 		 57 aa  56.2  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4185  Flp/Fap pilin component  38.78 
 
 		 61 aa  46.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2919  Flp/Fap pilin component  38.89 
 
 		 59 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.14248  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2642  Flp/Fap pilin component  37.74 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4473  Flp/Fap pilin component  35.42 
 
 		 62 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.837061  normal  0.806364 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0661  putative pilin transmembrane protein  44.68 
 
 		 53 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.406535  normal  0.487373 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3316  hypothetical protein  43.48 
 
 		 175 aa  42.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1399  Flp/Fap pilin component  39.62 
 
 		 54 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.41464  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2831  Flp/Fap pilin component  44.74 
 
 		 59 aa  40.4  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.676625  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>