19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2660 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2660  membrane protein-like protein  100 
 
 		 431 aa  833    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1086  membrane protein-like protein  31.21 
 
 		 443 aa  123  8e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.166386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0892  hypothetical protein  37.84 
 
 		 334 aa  73.6  0.000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2480  membrane protein  31.75 
 
 		 370 aa  68.2  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.404247  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0896  hypothetical protein  33.12 
 
 		 378 aa  67.4  0.0000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.555033  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1098  hypothetical protein  25 
 
 		 420 aa  64.7  0.000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00466748  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2331  hypothetical protein  29.05 
 
 		 376 aa  60.8  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4244  membrane protein  35.04 
 
 		 439 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1595  hypothetical protein  27.67 
 
 		 461 aa  59.3  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331924  normal  0.75872 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4393  membrane protein  36.09 
 
 		 436 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.153723  normal  0.326438 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4400  membrane protein  35.9 
 
 		 439 aa  59.7  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.849144  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4377  membrane protein  35.04 
 
 		 439 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.623693  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1895  hypothetical protein  23.64 
 
 		 416 aa  57.8  0.0000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3664  hypothetical protein  26 
 
 		 476 aa  53.1  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1503  conserved hypothetical conserved membrane protein  29.89 
 
 		 367 aa  51.6  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2356  membrane protein-like protein  28 
 
 		 442 aa  51.6  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00121464  hitchhiker  0.00000680633 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1829  hypothetical protein  33.33 
 
 		 219 aa  48.9  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.186354  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1363  hypothetical protein  28.38 
 
 		 703 aa  48.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000334966  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2379  hypothetical protein  27.04 
 
 		 478 aa  47.4  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0394731  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>