12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2353 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2353  hypothetical protein  100 
 
 		 247 aa  511  1e-144  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.8316  normal  0.0884418 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1363  hypothetical protein  34.8 
 
 		 250 aa  105  5e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.334501  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0005  hypothetical protein  26.92 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0200197  normal  0.107844 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0007  hypothetical protein  26.92 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0005  hypothetical protein  26.92 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.25819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3658  hypothetical protein  27.31 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0494  hypothetical protein  31.36 
 
 		 273 aa  45.4  0.0009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3046  hypothetical protein  32.32 
 
 		 219 aa  44.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00230108  normal  0.414867 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0005  hypothetical protein  31.87 
 
 		 126 aa  43.9  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06223  hypothetical protein  24.82 
 
 		 206 aa  43.5  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0692  hypothetical protein  30.56 
 
 		 215 aa  42  0.008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.143067  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1589  hypothetical protein  30.56 
 
 		 215 aa  42  0.008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>