16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1116 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1116  hypothetical protein  100 
 
 		 435 aa  867    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0069  phosphoethanolamine N-methyltransferase  28.87 
 
 		 264 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0516193  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1568  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.87 
 
 		 257 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1480  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.87 
 
 		 257 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.731828  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5778  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 276 aa  52  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  32.41 
 
 		 271 aa  49.7  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27050  glycine/sarcosine N-methyltransferase  29.03 
 
 		 559 aa  48.9  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.59391  normal  0.396997 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  33.04 
 
 		 279 aa  48.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  26.7 
 
 		 261 aa  47  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03100  sterol 24-C-methyltransferase, putative  24.06 
 
 		 343 aa  46.6  0.0008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0399554  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0809  Methyltransferase type 11  24.07 
 
 		 264 aa  46.6  0.0009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.266836  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4893  methyltransferase type 11  30.08 
 
 		 274 aa  45.1  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.242267 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16961  SAM-binding motif-containing protein  27.88 
 
 		 310 aa  44.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2966  Methyltransferase type 11  25.6 
 
 		 572 aa  44.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0650777 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2451  Methyltransferase type 11  25.6 
 
 		 267 aa  44.7  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.361549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0994  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  25.71 
 
 		 282 aa  43.5  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000209916  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>