18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2654 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2654  hypothetical protein  100 
 
 		 380 aa  778    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.113589  normal  0.0183141 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3271  hypothetical protein  27.13 
 
 		 404 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3382  hypothetical protein  26.04 
 
 		 395 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.127252  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1153  hypothetical protein  25.56 
 
 		 396 aa  82  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1587  hypothetical protein  22.66 
 
 		 355 aa  80.5  0.00000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.748272  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0062  hypothetical protein  30.5 
 
 		 424 aa  79.3  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2336  hypothetical protein  24.93 
 
 		 401 aa  79  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0189612 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2955  hypothetical protein  26.15 
 
 		 411 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.202209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2702  hypothetical protein  23.23 
 
 		 399 aa  62.8  0.000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4324  hypothetical protein  22.28 
 
 		 328 aa  58.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.404094  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3358  hypothetical protein  27.54 
 
 		 390 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.342415 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0087  hypothetical protein  19.61 
 
 		 422 aa  54.7  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.113697  unclonable  0.0000108237 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0569  hypothetical protein  27.83 
 
 		 389 aa  51.6  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1908  hypothetical protein  26.77 
 
 		 413 aa  50.8  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1969  hypothetical protein  25.41 
 
 		 378 aa  47.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.256858  normal  0.306966 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4333  hypothetical protein  29.79 
 
 		 434 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.989415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2793  hypothetical protein  26.75 
 
 		 393 aa  46.6  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2515  hypothetical protein  24.58 
 
 		 385 aa  44.7  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>