13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1969 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1969  hypothetical protein  100 
 
 		 378 aa  746    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.256858  normal  0.306966 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2553  hypothetical protein  77.78 
 
 		 378 aa  558  1e-158  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1212  hypothetical protein  77.78 
 
 		 392 aa  554  1e-156  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0328457 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4551  hypothetical protein  38.31 
 
 		 376 aa  153  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.339359 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0087  hypothetical protein  31.76 
 
 		 422 aa  62.8  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.113697  unclonable  0.0000108237 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1587  hypothetical protein  31.49 
 
 		 355 aa  59.3  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.748272  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4333  hypothetical protein  31.52 
 
 		 434 aa  49.7  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.989415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1153  hypothetical protein  28.74 
 
 		 396 aa  49.3  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2654  hypothetical protein  25.41 
 
 		 380 aa  47.8  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.113589  normal  0.0183141 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3382  hypothetical protein  26.39 
 
 		 395 aa  45.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.127252  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2955  hypothetical protein  31.82 
 
 		 411 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.202209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2336  hypothetical protein  29.73 
 
 		 401 aa  43.9  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0189612 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1589  hypothetical protein  22.83 
 
 		 397 aa  43.1  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>