16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3156 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_3156  hypothetical protein  100 
 
 
186 aa  380  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.633638 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3615  hypothetical protein  37.63 
 
 
170 aa  130  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.429674  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1224  hypothetical protein  38.89 
 
 
183 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.29961  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4690  hypothetical protein  36.47 
 
 
183 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_9916  hypothetical protein  26.71 
 
 
203 aa  50.8  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1996  hypothetical protein  26 
 
 
186 aa  50.1  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013733  Slin_7002  hypothetical protein  20.47 
 
 
188 aa  47.8  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.643238 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3399  hypothetical protein  28.07 
 
 
191 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0015092  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0939  conserved hypothetical protein, putative phage associated protein  25.44 
 
 
184 aa  46.2  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0243141  normal  0.950925 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0785  phage-associated protein  36.99 
 
 
165 aa  45.1  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.577777  normal  0.0707601 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1323  hypothetical protein  29.33 
 
 
161 aa  45.1  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.338891  hitchhiker  0.00835036 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0762  hypothetical protein  24.32 
 
 
183 aa  44.7  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.359066  normal  0.554709 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0353  helix-turn-helix domain-containing protein  51.43 
 
 
332 aa  43.9  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.747888  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0428  phage-associated protein-like protein  27.48 
 
 
178 aa  43.5  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0358952 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0451  hypothetical protein  26.36 
 
 
183 aa  42  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5705  hypothetical protein  23.57 
 
 
225 aa  41.2  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>