26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0766 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0766  DinB family protein  100 
 
 
165 aa  345  2e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.988165  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0081  DinB  37.5 
 
 
164 aa  105  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3853  hypothetical protein  32.72 
 
 
165 aa  92.8  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4547  DinB  30.91 
 
 
172 aa  89  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.521013  normal  0.113984 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0681  hypothetical protein  31.29 
 
 
165 aa  86.3  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.340859  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2312  DinB  30.72 
 
 
166 aa  83.2  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.223242 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4545  DinB  32.12 
 
 
172 aa  82.4  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.558483  normal  0.104149 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7171  DinB family protein  29.01 
 
 
170 aa  79  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000400672  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1959  DinB family protein  33.76 
 
 
166 aa  78.6  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.178951 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1083  DinB  28.4 
 
 
173 aa  74.7  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.437531  normal  0.0391417 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4656  hypothetical protein  31.06 
 
 
167 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0596  hypothetical protein  31.06 
 
 
167 aa  62  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3228  hypothetical protein  30.19 
 
 
167 aa  60.8  0.000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4640  hypothetical protein  31.06 
 
 
167 aa  60.8  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4276  hypothetical protein  30.43 
 
 
167 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.235759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4266  hypothetical protein  30.12 
 
 
167 aa  60.1  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4643  hypothetical protein  30.12 
 
 
167 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4426  hypothetical protein  30.43 
 
 
167 aa  59.7  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4358  DinB family protein  31.55 
 
 
167 aa  59.3  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4768  hypothetical protein  30.43 
 
 
167 aa  59.7  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.400929  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4655  hypothetical protein  30.43 
 
 
167 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0178  DinB family protein  26 
 
 
154 aa  48.9  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1058  DinB family protein  23.7 
 
 
154 aa  47.4  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4454  DinB family protein  26.62 
 
 
176 aa  45.8  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0326634  normal  0.0623797 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1276  DinB family protein  28.82 
 
 
166 aa  45.1  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3373  DinB family protein  25.66 
 
 
181 aa  42  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.580078 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>