34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5697 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_5697  hypothetical protein  100 
 
 
737 aa  1518    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.405224 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00635  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  66.13 
 
 
742 aa  988    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.617158  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1970  hypothetical protein  67.07 
 
 
738 aa  1031    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2443  hypothetical protein  66.4 
 
 
739 aa  1019    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3739  hypothetical protein  65.09 
 
 
740 aa  1006    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3795  hypothetical protein  44.82 
 
 
740 aa  587  1e-166  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.542831  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2098  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.2 
 
 
744 aa  471  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1082  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.51 
 
 
743 aa  466  9.999999999999999e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6419  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.32 
 
 
729 aa  435  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0229441  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2297  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.64 
 
 
706 aa  318  2e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.735492  hitchhiker  0.00060401 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0295  hypothetical protein  30.5 
 
 
425 aa  164  4.0000000000000004e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0359768  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1252  subtilisin-like serine protease  25.18 
 
 
751 aa  94.7  6e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.950247  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0499  hypothetical protein  23.96 
 
 
755 aa  87.8  7e-16  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.0510016  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4146  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.61 
 
 
729 aa  80.1  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0370543 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2107  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  23.26 
 
 
760 aa  74.3  0.000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.817284  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3058  hypothetical protein  22.11 
 
 
790 aa  70.9  0.00000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0523  hypothetical protein  24.3 
 
 
743 aa  63.2  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3322  S8A family peptidase  23.26 
 
 
795 aa  59.7  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.546962  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1555  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.28 
 
 
1078 aa  59.7  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11414  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2639  hypothetical protein  23.23 
 
 
821 aa  57  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0443804  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3564  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.16 
 
 
1060 aa  54.7  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0292  hypothetical protein  23.56 
 
 
355 aa  54.7  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00116575  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0448  hypothetical protein  22.22 
 
 
712 aa  53.9  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5792  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  30.05 
 
 
1285 aa  50.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.193425  normal  0.237593 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4312  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.72 
 
 
1253 aa  48.5  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.338305 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4195  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.63 
 
 
1086 aa  47  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0130517  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5900  hypothetical protein  25.26 
 
 
792 aa  46.2  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5007  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.88 
 
 
554 aa  46.2  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.674675  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3502  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  27.72 
 
 
1106 aa  46.2  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.250656  hitchhiker  0.00117601 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1465  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.17 
 
 
1230 aa  46.2  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.233669 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0083  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  24.32 
 
 
1361 aa  45.1  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0513  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.34 
 
 
1212 aa  45.1  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3050  protease-associated PA  29.32 
 
 
1220 aa  44.7  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000558142  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0066  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.9 
 
 
491 aa  44.3  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.592117  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>