14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0734 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0734  hypothetical protein  100 
 
 
122 aa  248  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.26257  normal  0.126132 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0817  hypothetical protein  33.05 
 
 
119 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.517567 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0641  hypothetical protein  34.19 
 
 
122 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4660  hypothetical protein  33.33 
 
 
119 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4578  hypothetical protein  35.82 
 
 
122 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1832  hypothetical protein  39.71 
 
 
119 aa  57  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.568838  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2911  hypothetical protein  36.07 
 
 
123 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1963  hypothetical protein  35.25 
 
 
123 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1831  hypothetical protein  39.19 
 
 
121 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.540626  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3185  hypothetical protein  41.1 
 
 
128 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0769435  hitchhiker  0.00869472 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1557  hypothetical protein  33.33 
 
 
119 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.444795  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3476  hypothetical protein  33.78 
 
 
123 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0693193  decreased coverage  0.00711492 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1553  hypothetical protein  38.46 
 
 
124 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00238513  normal  0.335767 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2380  hypothetical protein  29.41 
 
 
127 aa  41.6  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00182517 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>