36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3435 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3435  fermentation/respiration switch protein  100 
 
 		 416 aa  868    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3288  fermentation/respiration switch protein  95.19 
 
 		 416 aa  826    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0898  fermentation/respiration switch protein  75.9 
 
 		 416 aa  669    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0931  fermentation/respiration switch protein  73.85 
 
 		 415 aa  652    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3290  fermentation/respiration switch protein  70.84 
 
 		 415 aa  629  1e-179  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.110403  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3303  fermentation/respiration switch protein  70.84 
 
 		 415 aa  629  1e-179  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000661178  hitchhiker  0.000575901 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3152  fermentation/respiration switch protein  70.84 
 
 		 415 aa  629  1e-179  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0965  fermentation/respiration switch protein  67.71 
 
 		 415 aa  600  1e-170  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0765  fermentation/respiration switch protein  65.87 
 
 		 414 aa  585  1e-166  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.15727 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0348  fermentation/respiration switch protein  65.23 
 
 		 414 aa  582  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0357  fermentation/respiration switch protein  65.47 
 
 		 414 aa  582  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0359  fermentation/respiration switch protein  65.47 
 
 		 414 aa  582  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000175577 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0367  fermentation/respiration switch protein  65.23 
 
 		 414 aa  580  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0352  fermentation/respiration switch protein  65.23 
 
 		 414 aa  580  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0271  fermentation/respiration switch protein  65.14 
 
 		 414 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0266  fermentation/respiration switch protein  65.14 
 
 		 414 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3368  protein of unknown function DUF1100 hydrolase family protein  64.66 
 
 		 414 aa  571  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00237  hypothetical protein  64.9 
 
 		 414 aa  572  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0236  fermentation/respiration switch protein  64.9 
 
 		 414 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3342  fermentation/respiration switch protein  64.9 
 
 		 414 aa  572  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00234  fermentation/respiration switch protein  64.9 
 
 		 414 aa  572  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0293  fermentation/respiration switch protein  64.9 
 
 		 414 aa  572  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0072363 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0284  fermentation/respiration switch protein  64.66 
 
 		 414 aa  571  1e-161  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.117184  normal  0.397141 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1866  fermentation/respiration switch protein  43.1 
 
 		 415 aa  331  1e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000738572  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0976  fermentation/respiration switch protein  40.68 
 
 		 413 aa  312  5.999999999999999e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004270  hypothetical protein  39.32 
 
 		 415 aa  311  1e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.291288  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01160  fermentation/respiration switch protein  39.32 
 
 		 415 aa  310  5e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2955  fermentation/respiration switch protein  38.46 
 
 		 419 aa  293  3e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.283852  normal  0.148271 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0890  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  24.34 
 
 		 357 aa  49.3  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.712139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03823  Alpha/beta hydrolase fold protein  24.81 
 
 		 310 aa  47  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6210  Acetyl xylan esterase  24.49 
 
 		 402 aa  46.2  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5460  protein of unknown function DUF1100 hydrolase family protein  24.02 
 
 		 424 aa  46.2  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.528765  normal  0.198358 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1006  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  27.73 
 
 		 438 aa  45.1  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.342716 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2440  peptidase S15  22.73 
 
 		 298 aa  44.3  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3180  carboxymethylenebutenolidase  28.37 
 
 		 433 aa  44.3  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000051009  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2038  peptidase S15  33.87 
 
 		 306 aa  43.1  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.907978  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>