189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3530 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3530  siderophore-interacting protein  100 
 
 		 267 aa  535  1e-151  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2122  Siderophore-interacting protein  39.61 
 
 		 278 aa  158  9e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2693  Siderophore-interacting protein  37.89 
 
 		 272 aa  99.4  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.285306  normal  0.0865031 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0888  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  35.43 
 
 		 279 aa  94.7  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1323  Siderophore-interacting protein  34.55 
 
 		 297 aa  92.8  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06780  siderophore-interacting protein  32.69 
 
 		 284 aa  92.8  5e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.942698 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3539  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  35.48 
 
 		 268 aa  90.1  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0985281 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0387  Siderophore-interacting protein  34.22 
 
 		 247 aa  89.4  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2810  FAD-binding 9, siderophore-interacting  31.5 
 
 		 348 aa  89.4  6e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.445177  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1592  Siderophore-interacting protein  32.28 
 
 		 259 aa  88.2  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1860  iron-chelator utilization protein  33.88 
 
 		 273 aa  87  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0336  siderophore-interacting protein  34.76 
 
 		 361 aa  87  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152303  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0811  FAD-binding 9, siderophore-interacting  33.33 
 
 		 225 aa  87  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.330061  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06920  hypothetical protein  30.77 
 
 		 272 aa  86.7  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0237  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  33.68 
 
 		 266 aa  85.9  6e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3427  siderophore-interacting protein  34.85 
 
 		 277 aa  85.9  7e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0328876  normal  0.310709 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2021  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  33.88 
 
 		 281 aa  85.5  8e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.523412 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0021  siderophore-interacting protein  36.9 
 
 		 275 aa  85.5  9e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1528  siderophore-interacting protein  36.9 
 
 		 275 aa  85.5  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2126  FAD-binding 9, siderophore-interacting  32.34 
 
 		 277 aa  85.5  9e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00704936  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1173  siderophore-interacting protein  36.9 
 
 		 275 aa  85.5  9e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1453  siderophore-interacting protein  36.9 
 
 		 275 aa  85.5  9e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0029  siderophore-interacting protein  36.9 
 
 		 275 aa  85.5  9e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000742042  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0027  siderophore-interacting protein  36.9 
 
 		 275 aa  85.5  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0026  siderophore-interacting protein  36.9 
 
 		 275 aa  85.5  9e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1452  Siderophore-interacting protein  34.39 
 
 		 275 aa  84.7  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.100932  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3804  siderophore-interacting protein  33.67 
 
 		 277 aa  83.6  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.48919  normal  0.177514 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1901  siderophore-interacting protein  32.11 
 
 		 366 aa  83.2  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2205  siderophore-interacting protein  32.71 
 
 		 281 aa  82.8  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.2309  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1601  Siderophore-interacting protein  31.94 
 
 		 265 aa  82.8  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.168298 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5308  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  34.55 
 
 		 270 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4272  siderophore-interacting protein  34.59 
 
 		 281 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4986  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  33.97 
 
 		 273 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4296  Siderophore-interacting protein  32.68 
 
 		 340 aa  82  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000530029 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2366  Siderophore-interacting protein  34.97 
 
 		 258 aa  81.3  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.277442  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3129  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  34.45 
 
 		 273 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3043  siderophore-interacting protein  30.57 
 
 		 623 aa  79.3  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4275  siderophore-interacting protein  32.56 
 
 		 295 aa  79.3  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.716792  normal  0.162196 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0833  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  32.11 
 
 		 267 aa  78.6  0.00000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2566  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  30.63 
 
 		 312 aa  78.6  0.00000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.108893 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2724  Siderophore-interacting protein  31.91 
 
 		 311 aa  78.2  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4066  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  33 
 
 		 275 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.515055 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0773  siderophore-interacting protein  33.81 
 
 		 279 aa  78.6  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.71701  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3695  Siderophore-interacting protein  31.71 
 
 		 298 aa  78.2  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3953  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  33 
 
 		 275 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.568339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5976  iron transport/utilisation related protein  32.5 
 
 		 280 aa  77.4  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.129591 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3016  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  31.58 
 
 		 275 aa  77.8  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.565468  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2401  Siderophore-interacting protein  32 
 
 		 276 aa  77  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000149826  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2101  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  32.39 
 
 		 296 aa  76.6  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.41911  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5630  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  34.74 
 
 		 283 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4221  Siderophore-interacting protein  32.2 
 
 		 242 aa  77  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.186692  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0911  siderophore-interacting protein  29.32 
 
 		 234 aa  76.3  0.0000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0168967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37330  siderophore-interacting protein  31.4 
 
 		 291 aa  75.5  0.0000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1091  putative iron transport/utilisation related protein  34.21 
 
 		 275 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0143564 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21440  siderophore-interacting protein  30.05 
 
 		 277 aa  75.1  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.522532  normal  0.530536 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2932  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  31.55 
 
 		 275 aa  75.1  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453632  hitchhiker  0.000505579 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6722  Siderophore-interacting protein  32.77 
 
 		 349 aa  75.1  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.550685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2184  siderophore-interacting protein  25.52 
 
 		 246 aa  74.3  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.249595  normal  0.170908 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0535  Siderophore-interacting protein  30.85 
 
 		 617 aa  74.7  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.911825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25640  siderophore-interacting protein  29.58 
 
 		 274 aa  73.9  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.819064  normal  0.256648 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4137  siderophore-interacting protein  31.44 
 
 		 281 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1086  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  29.95 
 
 		 252 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03709  hypothetical protein  32.67 
 
 		 277 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1097  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  30.48 
 
 		 253 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.155373 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3477  Siderophore-interacting protein  32.82 
 
 		 289 aa  73.6  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4356  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  30.48 
 
 		 253 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.386359 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1988  FAD-binding 9, siderophore-interacting  31.44 
 
 		 285 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2034  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  31.44 
 
 		 285 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.870658  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1856  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  31.25 
 
 		 283 aa  72.4  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0769877  normal  0.504316 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1968  siderophore-interacting protein  31.44 
 
 		 285 aa  72.4  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0023  siderophore-interacting protein  33.15 
 
 		 275 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.403062  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4199  FAD-binding 9, siderophore-interacting protein  32.37 
 
 		 270 aa  71.6  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0118  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  29.86 
 
 		 370 aa  72  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000911  utilization protein for catechol-siderophore  30.88 
 
 		 257 aa  71.6  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1056  iron-chelator utilization protein, putative  30.48 
 
 		 253 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3163  siderophore-interacting protein  32.64 
 
 		 273 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4373  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  26.21 
 
 		 277 aa  70.5  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0726253  normal  0.734809 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4255  siderophore-interacting protein  28.71 
 
 		 250 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2762  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  28.9 
 
 		 299 aa  70.1  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1126  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  32.28 
 
 		 271 aa  70.5  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.708544  normal  0.382701 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0871  siderophore-interacting protein  26.5 
 
 		 247 aa  70.1  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.314795  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5142  FAD-binding 9, siderophore-interacting  32.54 
 
 		 273 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.145805  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5717  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  32.54 
 
 		 273 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.263002 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0363  Siderophore-interacting protein  31.72 
 
 		 265 aa  69.7  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0112  Siderophore-interacting protein  30.85 
 
 		 277 aa  69.3  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0096  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  28.22 
 
 		 247 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0099  siderophore-interacting protein  29.21 
 
 		 252 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0918  Siderophore-interacting protein  31.34 
 
 		 273 aa  68.9  0.00000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.154441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1802  vibriobactin utilization protein ViuB  26.18 
 
 		 271 aa  68.9  0.00000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1159  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  38.94 
 
 		 281 aa  68.2  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.139634  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3687  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  30.46 
 
 		 289 aa  68.6  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.443256  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0634  FAD-binding 9, siderophore-interacting  30.73 
 
 		 274 aa  68.6  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3731  Siderophore-interacting protein  37.29 
 
 		 356 aa  68.2  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08230  siderophore-interacting protein  29.08 
 
 		 282 aa  68.2  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.227116  normal  0.630679 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20830  siderophore-interacting protein  29.63 
 
 		 288 aa  68.2  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.93855  normal  0.0153538 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0094  siderophore-interacting protein  28.22 
 
 		 250 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5549  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  26.32 
 
 		 308 aa  68.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.438451  normal  0.147517 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4106  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  33.5 
 
 		 280 aa  67.8  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.375544  normal  0.287442 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2998  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  29.86 
 
 		 298 aa  68.2  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0124793  normal  0.0292007 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2442  Siderophore-interacting protein  32 
 
 		 267 aa  67.4  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.402244  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>