22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3067 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3067  hypothetical protein  100 
 
 		 58 aa  110  9e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.205429 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3174  hypothetical protein  91.67 
 
 		 150 aa  88.2  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0712  hypothetical protein  57.14 
 
 		 205 aa  74.3  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.583463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4017  hypothetical protein  61.4 
 
 		 207 aa  72  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0739843 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0579  hypothetical protein  62.5 
 
 		 185 aa  72  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.336002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3529  hypothetical protein  56.9 
 
 		 176 aa  67.8  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.452767  normal  0.831541 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1206  hypothetical protein  56.9 
 
 		 176 aa  67.8  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7729  hypothetical protein  61.22 
 
 		 62 aa  57.4  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0250143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0525  hypothetical protein  58.33 
 
 		 174 aa  55.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2866  hypothetical protein  49.02 
 
 		 237 aa  55.1  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794239  normal  0.0242431 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3182  hypothetical protein  42.11 
 
 		 167 aa  53.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00860952  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0761  hypothetical protein  47.06 
 
 		 169 aa  52.8  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3017  hypothetical protein  42.11 
 
 		 177 aa  52.4  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3074  hypothetical protein  45.45 
 
 		 177 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.426221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3345  hypothetical protein  44.64 
 
 		 173 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.126619  normal  0.961104 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2247  hypothetical protein  40.82 
 
 		 248 aa  47.8  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1514  hypothetical protein  38.6 
 
 		 131 aa  47.4  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.338897 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3815  hypothetical protein  36.84 
 
 		 124 aa  47  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.757001 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3838  hypothetical protein  56.25 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0788301  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3911  hypothetical protein  41.38 
 
 		 192 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1487  hypothetical protein  38.6 
 
 		 211 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3365  hypothetical protein  45.9 
 
 		 124 aa  40.4  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.828629  normal  0.105235 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>