14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1926 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1926  hypothetical protein  100 
 
 		 71 aa  141  4e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.107906  normal  0.0270065 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0944  SlyX protein, putative  61.54 
 
 		 70 aa  82  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.729298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3552  hypothetical protein  64.62 
 
 		 66 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.920661  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3235  SlyX protein  64.62 
 
 		 66 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0502  SlyX protein, putative  50 
 
 		 64 aa  66.2  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.743002  normal  0.373998 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3950  hypothetical protein  49.23 
 
 		 66 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.399378  normal  0.0602392 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2956  hypothetical protein  47.06 
 
 		 69 aa  53.9  0.0000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.479909  normal  0.0513755 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4080  SlyX  34.29 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.867927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4907  SlyX family protein  37.88 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.576724  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4022  hypothetical protein  34.85 
 
 		 72 aa  41.2  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3105  SlyX family protein  43.75 
 
 		 69 aa  40.4  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343313  normal  0.020248 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4228  SlyX  35.71 
 
 		 71 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.823141 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3168  SlyX family protein  37.5 
 
 		 71 aa  40.4  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2515  SlyX family protein  37.5 
 
 		 71 aa  40.4  0.009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>