48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0548 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0548  transcription activator, effector binding  100 
 
 		 174 aa  364  1e-100  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.283386 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0560  hypothetical protein  92.09 
 
 		 177 aa  343  1e-93  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.754603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06778  hypothetical protein  36.02 
 
 		 149 aa  112  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0107  hypothetical protein  36.93 
 
 		 153 aa  109  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0580328  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2787  transcription activator effector binding  33.54 
 
 		 149 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.688559 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1557  transcription activator effector binding  32.93 
 
 		 154 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1563  transcription activator effector binding  32.93 
 
 		 154 aa  105  4e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1456  transcription activator, effector binding  32.32 
 
 		 154 aa  103  9e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.259797  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1592  transcription activator effector binding  32.32 
 
 		 154 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.372363 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2705  transcription activator, effector binding  34.12 
 
 		 149 aa  101  5e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2539  transcription activator, effector binding  34.12 
 
 		 149 aa  101  6e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2606  transcription activator, effector binding protein  34.12 
 
 		 149 aa  100  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2786  transcription activator, effector binding  31.29 
 
 		 146 aa  100  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2542  transcription activator, effector binding  31.48 
 
 		 152 aa  95.9  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0171  transcription activator, effector binding  35.63 
 
 		 156 aa  92  4e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.486669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0189  transcription activator effector binding  35.06 
 
 		 156 aa  90.9  8e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.4925  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1824  transcription activator effector binding  33.33 
 
 		 155 aa  89.7  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.343494  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1757  hypothetical protein  31.1 
 
 		 159 aa  89.4  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3143  transcription activator effector binding  33.54 
 
 		 165 aa  88.2  5e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3397  transcription activator effector binding  31.52 
 
 		 154 aa  86.7  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000497279  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0019  DNA-binding protein  30.73 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1440  transcription activator effector binding subunit  33.33 
 
 		 138 aa  73.2  0.000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.347846  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4749  transcription activator effector binding  29.05 
 
 		 158 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4660  DNA-binding protein  29.94 
 
 		 158 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5068  DNA-binding protein YobU  29.38 
 
 		 159 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5039  hypothetical protein  29.27 
 
 		 159 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0175  hypothetical protein  29.78 
 
 		 158 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5072  hypothetical protein  28.65 
 
 		 158 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4799  hypothetical protein  28.74 
 
 		 159 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5162  hypothetical protein  28.74 
 
 		 159 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4641  DNA-binding protein  28.25 
 
 		 159 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5066  hypothetical protein  28.66 
 
 		 158 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2308  transcription activator effector binding protein  26.54 
 
 		 155 aa  64.3  0.0000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.20456 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1998  transcription activator effector binding protein  28.19 
 
 		 153 aa  60.5  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000299964  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1875  hypothetical protein  30.25 
 
 		 154 aa  57  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3427  transcription activator effector binding  30.19 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0283  CTA2 subfamily 1 protein  27.33 
 
 		 158 aa  53.1  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000189572  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0763  transcription activator effector binding  25.3 
 
 		 146 aa  53.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000404433  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1034  transcription activator effector binding  25.29 
 
 		 128 aa  51.2  0.000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1342  CTA2 subfamily 1 protein  26.38 
 
 		 125 aa  50.1  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2928  transcription activator effector binding protein  22.29 
 
 		 185 aa  50.4  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.314738 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7160  transcription activator effector binding protein  21.38 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46886  normal  0.0205342 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2865  transcription activator effector binding  25.15 
 
 		 149 aa  49.3  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.372254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2199  transcription activator, effector binding  23.98 
 
 		 159 aa  48.5  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1918  transcription activator effector binding  27.54 
 
 		 148 aa  46.6  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00982966  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0711  transcription activator effector binding  21.3 
 
 		 155 aa  44.7  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3688  transcription activator effector binding  24.67 
 
 		 153 aa  43.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2436  transcription activator effector binding protein  21.95 
 
 		 157 aa  42.4  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.236328  normal  0.052404 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>