143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2956 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2956  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  100 
 
 		 342 aa  701    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007517  Gmet_3176  galactose-1-phosphate uridyl transferase, class I  56.73 
 
 		 353 aa  425  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.287349  normal  0.326175 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0857  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  55.56 
 
 		 341 aa  422  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3256  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  56.14 
 
 		 341 aa  415  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.14936  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0026  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  55.56 
 
 		 341 aa  411  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0409  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  54.68 
 
 		 341 aa  412  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009675  Anae109_0138  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  43.95 
 
 		 333 aa  318  1e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.264667  normal  1 
 
 
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NC_008009  Acid345_0343  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  44.38 
 
 		 344 aa  315  8e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.565046 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0152  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  44.12 
 
 		 333 aa  310  2e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0141  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  44.12 
 
 		 333 aa  310  2e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0134  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  43.53 
 
 		 333 aa  305  8.000000000000001e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.197262  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0450  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  44.74 
 
 		 341 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0031  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  41.4 
 
 		 336 aa  296  3e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000258935  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0031  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  41.4 
 
 		 336 aa  296  3e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000363361  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0076  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  37.72 
 
 		 332 aa  295  7e-79  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1935  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  43.82 
 
 		 338 aa  294  1e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0280643  hitchhiker  0.00000283662 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1387  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  39.77 
 
 		 343 aa  294  2e-78  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000338639  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0305  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  39.82 
 
 		 340 aa  293  4e-78  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.994775  n/a   
 
 
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NC_010003  Pmob_1106  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  41.35 
 
 		 336 aa  292  7e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010424  Daud_1323  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  42.35 
 
 		 351 aa  284  1.0000000000000001e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011899  Hore_01580  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  35.48 
 
 		 333 aa  236  5.0000000000000005e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011831  Cagg_1083  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  36.13 
 
 		 329 aa  221  9.999999999999999e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.135075  hitchhiker  0.0000927283 
 
 
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NC_011729  PCC7424_0267  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  32.46 
 
 		 331 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_014150  Bmur_0457  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  32.27 
 
 		 333 aa  206  3e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00409656  n/a   
 
 
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NC_014148  Plim_1971  UDP-glucose--hexose-1-phosphate uridylyltransferase  35.71 
 
 		 358 aa  201  1.9999999999999998e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010320  Teth514_0210  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  31.18 
 
 		 323 aa  199  5e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.290951  n/a   
 
 
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NC_008009  Acid345_2696  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  34.01 
 
 		 330 aa  194  2e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009767  Rcas_0974  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  33.62 
 
 		 341 aa  189  4e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.941679 
 
 
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NC_013161  Cyan8802_2741  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  31.58 
 
 		 333 aa  189  7e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00698708  unclonable  0.00000000287618 
 
 
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NC_011726  PCC8801_3370  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  31.58 
 
 		 333 aa  189  7e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_007404  Tbd_0601  galactose-1-phosphate uridyl transferase, class I  32.11 
 
 		 366 aa  186  4e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.582839 
 
 
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NC_007355  Mbar_A0295  sulfate adenylyltransferase (ADP)  31.9 
 
 		 334 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009523  RoseRS_3828  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  32.18 
 
 		 341 aa  181  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00089056 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0434  sulfate adenylyltransferase  31.69 
 
 		 329 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.142935  n/a   
 
 
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NC_013124  Afer_0499  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  32.95 
 
 		 332 aa  168  1e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.203347  n/a   
 
 
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NC_009954  Cmaq_0578  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  29.97 
 
 		 327 aa  163  5.0000000000000005e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000440232  hitchhiker  0.0017715 
 
 
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NC_008553  Mthe_1550  sulfate adenylyltransferase  33.22 
 
 		 288 aa  160  4e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008698  Tpen_1112  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  28.82 
 
 		 338 aa  155  8e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_5885  UDP-glucose--hexose-1- phosphateuridylyltransferase  33.14 
 
 		 330 aa  154  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011661  Dtur_1196  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  28.53 
 
 		 324 aa  151  1e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013525  Tter_0555  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  30.29 
 
 		 329 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009376  Pars_0315  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  29.75 
 
 		 314 aa  143  4e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010003  Pmob_0831  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  26.15 
 
 		 327 aa  137  3.0000000000000003e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008346  Swol_0522  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  28.51 
 
 		 242 aa  135  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00153645  n/a   
 
 
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NC_009718  Fnod_0416  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  27.04 
 
 		 318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011899  Hore_20670  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  26.51 
 
 		 329 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008578  Acel_1675  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  27.99 
 
 		 392 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00026893 
 
 
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NC_009073  Pcal_0777  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  25.86 
 
 		 313 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
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NC_013205  Aaci_2324  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  26.72 
 
 		 329 aa  128  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013757  Gobs_4057  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  29.11 
 
 		 366 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012034  Athe_0938  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  25.86 
 
 		 329 aa  127  3e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010085  Nmar_0538  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  27.01 
 
 		 338 aa  126  5e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
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NC_009616  Tmel_0424  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  22.64 
 
 		 320 aa  124  2e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.908762  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_7308  UDP-glucose--hexose-1- phosphateuridylyltransfera se  28.45 
 
 		 359 aa  122  9e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009486  Tpet_1561  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  24.57 
 
 		 318 aa  120  3e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010483  TRQ2_1627  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  24.57 
 
 		 318 aa  120  3e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3149  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  29.57 
 
 		 347 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0265697  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0698  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  25.36 
 
 		 324 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.40133  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14300  galactose-1-phosphate uridylyltransferase, family 1  27.91 
 
 		 374 aa  110  4.0000000000000004e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32890  galactose-1-phosphate uridylyltransferase, family 1  28.48 
 
 		 404 aa  108  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148922  normal  0.312276 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0894  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  28.28 
 
 		 359 aa  107  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0608445 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0619  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  28.12 
 
 		 364 aa  106  7e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011886  Achl_1234  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  25.5 
 
 		 382 aa  103  5e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000457515 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2212  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  28.01 
 
 		 423 aa  99.4  8e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.846104  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4904  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  26.06 
 
 		 360 aa  99  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.10792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0974  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  24.65 
 
 		 416 aa  98.6  1e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009972  Haur_1038  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  25.09 
 
 		 345 aa  97.4  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008010  Dgeo_2480  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  26.92 
 
 		 359 aa  97.1  4e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0773947  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1162  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  27.59 
 
 		 385 aa  97.1  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_7278  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  26.04 
 
 		 345 aa  97.1  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3972  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  26.5 
 
 		 381 aa  96.3  8e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.149521  normal  0.354456 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4108  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  24.35 
 
 		 361 aa  95.9  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_008346  Swol_0520  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  40.52 
 
 		 116 aa  94.4  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013526  Tter_2204  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  23.19 
 
 		 347 aa  94.4  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007912  Sde_1098  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  25.68 
 
 		 350 aa  93.6  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000020957  normal  0.395809 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3337  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  22.89 
 
 		 354 aa  93.6  5e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.469723  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1072  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  22.89 
 
 		 347 aa  92.8  7e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.794088  normal  0.0217531 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4017  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  23.77 
 
 		 361 aa  91.7  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2341  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  23.08 
 
 		 350 aa  90.9  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000258773 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2147  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  24.41 
 
 		 361 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.435359 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00231  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  23.11 
 
 		 329 aa  90.5  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1939  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  22.65 
 
 		 360 aa  89.7  7e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.509299  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0996  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  27.22 
 
 		 365 aa  86.3  8e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0874872  n/a   
 
 
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NC_012669  Bcav_2959  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  25.42 
 
 		 386 aa  84.7  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00353191  decreased coverage  0.000145306 
 
 
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NC_013159  Svir_32740  galactose-1-phosphate uridylyltransferase, family 1  25.73 
 
 		 342 aa  84.3  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.299136  normal  1 
 
 
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NC_011831  Cagg_0726  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  24.72 
 
 		 348 aa  84.3  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00106008  normal  1 
 
 
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NC_013501  Rmar_0492  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  23.56 
 
 		 351 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.033311  n/a   
 
 
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NC_007519  Dde_3652  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  23.05 
 
 		 358 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014151  Cfla_2489  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  25.14 
 
 		 405 aa  80.1  0.00000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008228  Patl_0648  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  22.49 
 
 		 349 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000133641  n/a   
 
 
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NC_009921  Franean1_1289  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  23.48 
 
 		 454 aa  79.3  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009441  Fjoh_1113  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  19.77 
 
 		 353 aa  79.3  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013946  Mrub_2813  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  22.86 
 
 		 346 aa  79  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0750754 
 
 
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CP001637  EcDH1_2884  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  22.34 
 
 		 348 aa  77.4  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009436  Ent638_1249  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  21.05 
 
 		 348 aa  77.8  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.398419 
 
 
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NC_009800  EcHS_A0812  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  22.34 
 
 		 348 aa  77.4  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009801  EcE24377A_0785  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  22.34 
 
 		 348 aa  77.4  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010468  EcolC_2904  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  22.34 
 
 		 348 aa  77.4  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.23532 
 
 
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NC_010498  EcSMS35_0781  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  22.34 
 
 		 348 aa  77.4  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008009  Acid345_1703  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  21.2 
 
 		 348 aa  77.4  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.330674 
 
 
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