168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0076 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0076  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  100 
 
 
332 aa  687    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0305  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  76.76 
 
 
340 aa  551  1e-156  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.994775  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0031  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  69.97 
 
 
336 aa  509  1e-143  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000258935  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0031  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  69.97 
 
 
336 aa  509  1e-143  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000363361  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1106  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  55.02 
 
 
336 aa  398  9.999999999999999e-111  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0343  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  51.79 
 
 
344 aa  386  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.565046 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1323  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  51.83 
 
 
351 aa  372  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0152  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  51.06 
 
 
333 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0141  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  50.76 
 
 
333 aa  368  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0134  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  50.45 
 
 
333 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.197262  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0138  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  49.1 
 
 
333 aa  360  2e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.264667  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1935  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  48.05 
 
 
338 aa  347  2e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0280643  hitchhiker  0.00000283662 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0450  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  49.1 
 
 
341 aa  343  2e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01580  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  46.83 
 
 
333 aa  332  5e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0026  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  46.2 
 
 
341 aa  332  6e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0857  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  45.03 
 
 
341 aa  331  1e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0409  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  45.03 
 
 
341 aa  327  1.0000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3176  galactose-1-phosphate uridyl transferase, class I  44.15 
 
 
353 aa  316  3e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.287349  normal  0.326175 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3256  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  43.79 
 
 
341 aa  312  5.999999999999999e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.14936  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1387  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  45.32 
 
 
343 aa  300  3e-80  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000338639  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2956  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  37.72 
 
 
342 aa  295  7e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0210  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  45.59 
 
 
323 aa  276  4e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.290951  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1083  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  37.61 
 
 
329 aa  261  2e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.135075  hitchhiker  0.0000927283 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0267  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  40.66 
 
 
331 aa  253  3e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3828  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  38.1 
 
 
341 aa  251  1e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00089056 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0974  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  38.05 
 
 
341 aa  248  1e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.941679 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0457  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  40.24 
 
 
333 aa  245  9e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00409656  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3370  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  38.69 
 
 
333 aa  237  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2741  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  38.69 
 
 
333 aa  237  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00698708  unclonable  0.00000000287618 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1971  UDP-glucose--hexose-1-phosphate uridylyltransferase  36 
 
 
358 aa  234  2.0000000000000002e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0601  galactose-1-phosphate uridyl transferase, class I  32.58 
 
 
366 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.582839 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0499  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  34.04 
 
 
332 aa  202  7e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.203347  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0434  sulfate adenylyltransferase  34.23 
 
 
329 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.142935  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0295  sulfate adenylyltransferase (ADP)  34.23 
 
 
334 aa  194  2e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2696  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  33.14 
 
 
330 aa  189  8e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1550  sulfate adenylyltransferase  34.9 
 
 
288 aa  186  6e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0522  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  38.43 
 
 
242 aa  177  2e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00153645  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0538  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  30.65 
 
 
338 aa  168  1e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1112  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  32.25 
 
 
338 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5885  UDP-glucose--hexose-1- phosphateuridylyltransferase  31.76 
 
 
330 aa  161  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0424  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  31.38 
 
 
320 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.908762  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20670  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  31.85 
 
 
329 aa  155  9e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0555  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  31.29 
 
 
329 aa  155  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1561  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  30.99 
 
 
318 aa  154  2e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0831  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  30.09 
 
 
327 aa  154  2e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1627  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  30.99 
 
 
318 aa  154  2e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0416  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  30.03 
 
 
318 aa  150  2e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0315  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  31.64 
 
 
314 aa  150  4e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1196  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  29.29 
 
 
324 aa  150  4e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0938  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  29.88 
 
 
329 aa  149  7e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0777  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  31.44 
 
 
313 aa  144  2e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0698  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  29.36 
 
 
324 aa  144  2e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.40133  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2324  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  27.68 
 
 
329 aa  144  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0578  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  29.04 
 
 
327 aa  143  4e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000440232  hitchhiker  0.0017715 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1703  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  26.88 
 
 
348 aa  135  8e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1675  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  27.16 
 
 
392 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00026893 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14300  galactose-1-phosphate uridylyltransferase, family 1  26.41 
 
 
374 aa  130  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4904  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  27.65 
 
 
360 aa  130  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.10792  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3149  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  26.87 
 
 
347 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0265697  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7308  UDP-glucose--hexose-1- phosphateuridylyltransfera se  27.16 
 
 
359 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0492  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  27.46 
 
 
351 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.033311  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7278  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  28.83 
 
 
345 aa  126  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4057  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  27.65 
 
 
366 aa  125  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1162  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  27.14 
 
 
385 aa  124  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1038  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  27.71 
 
 
345 aa  123  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1939  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  28.45 
 
 
360 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.509299  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1234  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  26.27 
 
 
382 aa  120  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000457515 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1885  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  28.08 
 
 
355 aa  120  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00396912 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2204  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  27.7 
 
 
347 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1113  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  28.89 
 
 
353 aa  120  3.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1098  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  28.03 
 
 
350 aa  119  4.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000020957  normal  0.395809 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0726  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  27.4 
 
 
348 aa  118  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00106008  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2890  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  27.56 
 
 
359 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0894  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  26.73 
 
 
359 aa  117  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0608445 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0543  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  26.72 
 
 
341 aa  116  6e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0619  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  26.25 
 
 
364 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2480  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  26.87 
 
 
359 aa  113  4.0000000000000004e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0773947  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3652  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  25.47 
 
 
358 aa  110  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32740  galactose-1-phosphate uridylyltransferase, family 1  26.27 
 
 
342 aa  110  4.0000000000000004e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.299136  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2813  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  26.98 
 
 
346 aa  109  5e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0750754 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1249  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  24.92 
 
 
348 aa  108  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.398419 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2887  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  26.43 
 
 
362 aa  108  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4017  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  27.27 
 
 
361 aa  107  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1172  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  26.43 
 
 
350 aa  107  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0902  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  26.37 
 
 
348 aa  105  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0870  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  26.37 
 
 
348 aa  105  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0811  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  26.37 
 
 
348 aa  105  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0925  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  26.37 
 
 
348 aa  105  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0737338 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0839  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  26.37 
 
 
348 aa  105  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1198  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  25.95 
 
 
372 aa  105  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2395  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  25.81 
 
 
346 aa  103  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2147  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  26.91 
 
 
361 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.435359 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4108  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  26.38 
 
 
361 aa  104  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2341  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  23.17 
 
 
350 aa  103  5e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000258773 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03329  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  25.63 
 
 
350 aa  103  6e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2884  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  26.05 
 
 
348 aa  102  7e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0812  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  26.05 
 
 
348 aa  102  7e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0785  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  26.05 
 
 
348 aa  102  7e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2904  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  26.05 
 
 
348 aa  102  7e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.23532 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2959  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  24 
 
 
386 aa  102  9e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00353191  decreased coverage  0.000145306 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>