33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2035 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2035  glycosyltransferase  100 
 
 		 390 aa  802    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2458  glycosyltransferase-like protein  57.03 
 
 		 378 aa  422  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1759  glycosyltransferase-like protein  56.51 
 
 		 378 aa  420  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.123674 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2856  glycosyltransferase-like protein  57.1 
 
 		 376 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1403  glycosyl transferase group 1  42.32 
 
 		 393 aa  290  4e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.944674  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1530  glycosyl transferase, group 1  43.54 
 
 		 380 aa  281  1e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2289  glycosyl transferase group 1  42.01 
 
 		 380 aa  272  9e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00582583 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0984  glycosyl transferase group 1  41.51 
 
 		 364 aa  258  1e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1696  glycosyl transferase group 1  41.02 
 
 		 366 aa  249  5e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2123  glycosyl transferase, group 1  41.49 
 
 		 350 aa  199  7.999999999999999e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.887263  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3631  glycosyl transferase, group 1  37.96 
 
 		 363 aa  199  7.999999999999999e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.190155  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0516  glycosyl transferase group 1  35.29 
 
 		 360 aa  186  6e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.869562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2466  glycosyl transferase group 1  34.76 
 
 		 390 aa  184  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2229  hypothetical protein  35.14 
 
 		 353 aa  177  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00330354 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1606  glycosyl transferase, group 1  33.91 
 
 		 357 aa  155  8e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.444102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1784  glycosyl transferase, group 1  24.88 
 
 		 379 aa  54.7  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11776  glycosyl transferase  27.33 
 
 		 381 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.99467e-19  hitchhiker  0.0000000000422341 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31920  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  34.62 
 
 		 420 aa  47.8  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1495  glycosyl transferase, group 1  26.92 
 
 		 361 aa  47.4  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.507628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  24.76 
 
 		 395 aa  47  0.0005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1034  glycosyl transferase group 1  26.76 
 
 		 389 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1844  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 348 aa  45.8  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0112136  normal  0.849327 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1063  glycosyl transferase group 1  26.06 
 
 		 389 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0481917 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3285  glycosyl transferase group 1  24.62 
 
 		 395 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2748  glycosyl transferase, group 1  29.56 
 
 		 388 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2973  UDP-N-acetylglucosamine  30.26 
 
 		 417 aa  45.1  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03650  glycosyltransferase  30 
 
 		 413 aa  45.1  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.736839  normal  0.451667 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3019  glycosyl transferase group 1  31.37 
 
 		 370 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2416  glycosyl transferase, group 1  25.76 
 
 		 391 aa  45.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0844793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2792  glycosyl transferase, group 1  29.56 
 
 		 388 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2778  glycosyl transferase, group 1  29.56 
 
 		 388 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.457571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3033  glycosyl transferase, group 1  27.85 
 
 		 368 aa  44.3  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.125228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1247  glycosyl transferase, group 1  25.57 
 
 		 391 aa  43.5  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.174724  normal  0.678195 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>