29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1743 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1743  kinase  100 
 
 
255 aa  518  1e-146  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.11698 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0564  ribokinase-like domain-containing protein  63.2 
 
 
256 aa  341  5e-93  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000354335 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1554  ribokinase-like domain-containing protein  61.6 
 
 
256 aa  319  3e-86  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1734  ribokinase-like domain-containing protein  57.2 
 
 
281 aa  305  4.0000000000000004e-82  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.264913  decreased coverage  0.000421461 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3082  PfkB domain protein  28.25 
 
 
284 aa  52  0.000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.925823  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2948  ribokinase-like domain-containing protein  29.51 
 
 
283 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.64332 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3619  PfkB domain-containing protein  36.19 
 
 
309 aa  50.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2985  carbohydrate kinase, PfkB  28.25 
 
 
284 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0222551  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0612  ribokinase-like domain-containing protein  26.88 
 
 
315 aa  49.7  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.27452  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0275  PfkB domain-containing protein  28.48 
 
 
312 aa  49.3  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3963  ribokinase-like domain-containing protein  30.23 
 
 
272 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.312464 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0398  ribokinase-like domain-containing protein  27.31 
 
 
287 aa  47  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.688788  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3183  PfkB domain protein  26.91 
 
 
284 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.203833  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0562  PfkB domain protein  38.03 
 
 
299 aa  45.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1429  ribokinase-like domain-containing protein  27.83 
 
 
272 aa  43.9  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.664632  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2234  PfkB domain protein  26.99 
 
 
319 aa  44.3  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0749  ribokinase  29.07 
 
 
306 aa  43.9  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000720941  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0922  ribokinase-like domain-containing protein  22.58 
 
 
289 aa  43.5  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0996  PfkB domain protein  30 
 
 
333 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1128  conserved hypothetical protein  23.98 
 
 
257 aa  43.1  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0143  ribokinase-like domain-containing protein  24.21 
 
 
259 aa  43.1  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000113671  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0635  ribokinase-like domain-containing protein  23.42 
 
 
315 aa  43.1  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.377528  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2118  PfkB domain protein  31.08 
 
 
307 aa  43.1  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2365  PfkB domain-containing protein  39.68 
 
 
313 aa  43.1  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0300  ribokinase family sugar kinase  27.04 
 
 
320 aa  42.7  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.750208  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0624  ribokinase-like domain-containing protein  44.12 
 
 
313 aa  42.4  0.008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00311973 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0692  carbohydrate kinase  41.82 
 
 
304 aa  42  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.19709  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2838  ribokinase  32.14 
 
 
314 aa  42  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760591  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  35.37 
 
 
298 aa  42  0.01  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>