66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0944 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_0944  phosphate uptake regulator, PhoU  100 
 
 
337 aa  669    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0860  phosphate uptake regulator, PhoU  78.34 
 
 
339 aa  551  1e-156  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.198015 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1393  phosphate uptake regulator, PhoU  78.74 
 
 
335 aa  543  1e-153  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1926  phosphate uptake regulator, PhoU  77.58 
 
 
330 aa  531  1e-150  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.820933  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0447  phosphate uptake regulator, PhoU  34.5 
 
 
349 aa  196  6e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000672536  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1682  phosphate uptake regulator, PhoU  31.61 
 
 
336 aa  144  2e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1968  phosphate uptake regulator, PhoU  33.76 
 
 
336 aa  139  8.999999999999999e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1604  phosphate uptake regulator, PhoU  28.79 
 
 
348 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1069  phosphate uptake regulator, PhoU  32 
 
 
340 aa  126  5e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1794  phosphate uptake regulator, PhoU  33.33 
 
 
332 aa  125  1e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0479748 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1119  hypothetical protein  27.83 
 
 
333 aa  123  4e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.588146  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1425  phosphate uptake regulator, PhoU  28.13 
 
 
335 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0495  phosphate uptake regulator, PhoU  32.34 
 
 
331 aa  119  7.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3440  phosphate uptake regulator, PhoU  28.46 
 
 
331 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2400  phosphate uptake regulator, PhoU  26.81 
 
 
344 aa  117  3e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.282043 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1765  hypothetical protein  31.27 
 
 
336 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2476  phosphate uptake regulator, PhoU  31.03 
 
 
331 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0914  phosphate uptake regulator, PhoU  32.34 
 
 
334 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2356  phosphate uptake regulator, PhoU  31.33 
 
 
334 aa  113  4.0000000000000004e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1545  phosphate uptake regulator, PhoU  29.18 
 
 
332 aa  109  6e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0897  phosphate uptake regulator, PhoU  25.55 
 
 
331 aa  109  6e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.247428  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0479  phosphate uptake regulator, PhoU  25.82 
 
 
337 aa  109  7.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2950  putative regulatory protein  28.57 
 
 
293 aa  106  5e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11037  normal  0.0119157 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1622  SpoVT/AbrB domain-containing protein  30.74 
 
 
349 aa  96.7  5e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00903094  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0620  phosphate uptake regulator, PhoU  28.18 
 
 
336 aa  94  3e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1329  phosphate uptake regulator, PhoU  33.47 
 
 
351 aa  93.2  6e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.445187  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1065  phosphate uptake regulator, PhoU  29.87 
 
 
316 aa  89.4  7e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0353  phosphate uptake regulator, PhoU  31.3 
 
 
350 aa  87.4  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0896452  normal  0.250975 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0595  phosphate uptake regulator, PhoU  25.53 
 
 
335 aa  82.8  0.000000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2363  phosphate uptake regulator, PhoU  26.92 
 
 
344 aa  82  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.486275  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1597  SpoVT/AbrB domain protein  26.41 
 
 
327 aa  80.9  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.755665  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3128  hypothetical protein  28.43 
 
 
304 aa  76.6  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1717  phosphate uptake regulator, PhoU  25.54 
 
 
326 aa  73.6  0.000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0358933 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1109  SpoVT/AbrB domain-containing protein  26.99 
 
 
331 aa  72.4  0.00000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.235676  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1883  hypothetical protein  27.66 
 
 
277 aa  71.6  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.85602 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1659  SpoVT/AbrB domain-containing protein  21.01 
 
 
326 aa  64.7  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.724868  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2336  phosphate uptake regulator, PhoU  21.71 
 
 
344 aa  65.1  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.119502  normal  0.953358 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1287  phosphate uptake regulator, PhoU  25.08 
 
 
297 aa  64.7  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0312  phosphate uptake regulator, PhoU  20.85 
 
 
344 aa  64.3  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1904  SpoVT/AbrB domain protein  23.4 
 
 
333 aa  61.2  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.365247  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1600  phosphate uptake regulator, PhoU  26.09 
 
 
299 aa  59.3  0.00000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2335  phosphate uptake regulator, PhoU  22.41 
 
 
343 aa  58.2  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0693  phosphate uptake regulator, PhoU  21.07 
 
 
343 aa  57.8  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.571595  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1386  phosphate uptake regulator, PhoU  21.89 
 
 
343 aa  56.6  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2279  phosphate uptake regulator, PhoU  31.13 
 
 
216 aa  55.1  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2081  phosphate uptake regulator, PhoU  22.5 
 
 
297 aa  54.3  0.000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0893566 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1831  phosphate uptake regulator, PhoU  22.79 
 
 
297 aa  53.1  0.000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000208314 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1015  phosphate uptake regulator, PhoU  22.64 
 
 
297 aa  52.8  0.000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.313422 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2984  phosphate uptake regulator, PhoU  41.86 
 
 
216 aa  52.8  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3556  SpoVT/AbrB domain protein  20.79 
 
 
339 aa  52  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1258  phosphate uptake regulator, PhoU  38.24 
 
 
236 aa  49.7  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.508687  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0483  phosphate uptake regulator, PhoU  28.74 
 
 
216 aa  45.8  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2293  phosphate uptake regulator, PhoU  35.16 
 
 
236 aa  44.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.612527  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2340  phosphate uptake regulator, PhoU  31.87 
 
 
239 aa  45.1  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.521848  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1537  phosphate transport system protein  37.36 
 
 
237 aa  45.1  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.290389 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1923  phosphate uptake regulator, PhoU  32.97 
 
 
242 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.602202  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2837  phosphate uptake regulator, PhoU  28.12 
 
 
214 aa  44.7  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5184  phosphate uptake regulator, PhoU  30.77 
 
 
237 aa  44.3  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4717  phosphate transport system regulatory protein PhoU  30.77 
 
 
237 aa  44.3  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.286694 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5256  phosphate uptake regulator, PhoU  29.67 
 
 
237 aa  43.9  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0641266  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0602  phosphate uptake regulator, PhoU  35.56 
 
 
243 aa  43.9  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.226674  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7424  phosphate uptake regulator, PhoU  30.77 
 
 
239 aa  43.1  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2600  phosphate uptake regulator, PhoU  32.97 
 
 
241 aa  43.1  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1258  phosphate uptake regulator, PhoU  32.97 
 
 
241 aa  43.1  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0430  SpoVT/AbrB domain protein  24.56 
 
 
315 aa  43.5  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1542  phosphate uptake regulator, PhoU  30 
 
 
234 aa  42.7  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0547661  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>