26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1819 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1819  hypothetical protein  100 
 
 		 100 aa  205  2e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0698228  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2221  hypothetical protein  68.48 
 
 		 95 aa  137  3e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00323479  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2546  hypothetical protein  63.54 
 
 		 115 aa  136  8.999999999999999e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.211724  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2318  hypothetical protein  61.11 
 
 		 100 aa  130  6e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0137  hypothetical protein  59.18 
 
 		 118 aa  129  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3321  hypothetical protein  70 
 
 		 96 aa  127  5.0000000000000004e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2552  hypothetical protein  59.78 
 
 		 96 aa  126  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.230883  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1930  hypothetical protein  63.04 
 
 		 100 aa  124  3e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4743  hypothetical protein  76.81 
 
 		 101 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.369246  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0856  hypothetical protein  56.84 
 
 		 97 aa  117  4.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4057  hypothetical protein  64.52 
 
 		 96 aa  110  4.0000000000000004e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0954  hypothetical protein  74.24 
 
 		 74 aa  110  5e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1114  hypothetical protein  74.24 
 
 		 74 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003649  hypothetical protein  71.21 
 
 		 69 aa  108  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.13895  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1958  hypothetical protein  59.04 
 
 		 104 aa  103  6e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.781957  normal  0.865529 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2938  protein of unknown function UPF0153  48.75 
 
 		 134 aa  87.4  6e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0781616  normal  0.823216 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04095  hypothetical protein  40.91 
 
 		 83 aa  58.9  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4386  protein of unknown function UPF0153  34.04 
 
 		 228 aa  52  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365173  normal  0.783994 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1877  hypothetical protein  37.33 
 
 		 224 aa  48.1  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0768  protein of unknown function UPF0153  38.46 
 
 		 198 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.932399 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2539  protein of unknown function UPF0153  38.46 
 
 		 116 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10181  Fe-S-cluster oxidoreductase  64 
 
 		 115 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1365  hypothetical protein  33.7 
 
 		 361 aa  41.2  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.493188  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3172  hypothetical protein  36.21 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0589  Fe-S-cluster oxidoreductase-like  34.88 
 
 		 220 aa  40.4  0.008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0309459  normal  0.576133 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0504  hypothetical protein  29.47 
 
 		 131 aa  40  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>