38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1947 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1947  ComEA-related protein  100 
 
 		 162 aa  323  5e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2181  ComEA-related protein  48.17 
 
 		 163 aa  124  7e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.204715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2129  Helix-hairpin-helix DNA-binding class 1  38.8 
 
 		 183 aa  102  3e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0279  helix-hairpin-helix DNA-binding, class 1  34.73 
 
 		 170 aa  92  3e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0666244 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2555  Helix-hairpin-helix DNA-binding class 1  36.84 
 
 		 172 aa  87.4  8e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2285  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  32 
 
 		 175 aa  79  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1625  helix-hairpin-helix DNA-binding, class 1  31.43 
 
 		 172 aa  63.9  0.0000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1741  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  45.45 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0277947  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2512  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  33.61 
 
 		 213 aa  50.8  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1103  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  40.91 
 
 		 187 aa  47.8  0.00006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000407291  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17420  competence protein ComEA-like protein with helix-hairpin-helix repeat region  30.68 
 
 		 279 aa  45.8  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.711078  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1982  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  33.33 
 
 		 274 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000014049 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1484  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  32.89 
 
 		 194 aa  46.2  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1230  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  27.94 
 
 		 296 aa  45.4  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.890666  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3304  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  37.29 
 
 		 214 aa  45.1  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0506678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4178  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  33.33 
 
 		 199 aa  44.7  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.666456  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3435  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  42 
 
 		 304 aa  44.3  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0218719  normal  0.0106956 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0570  competence protein ComEA helix-hairpin-helix region  36.92 
 
 		 224 aa  44.3  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000494468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1008  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  33.75 
 
 		 114 aa  43.9  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000463906  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12590  DNA uptake protein  31.33 
 
 		 352 aa  44.3  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1756  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  30.12 
 
 		 181 aa  44.3  0.0008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1000  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  34.72 
 
 		 207 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1122  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  41.82 
 
 		 235 aa  43.9  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.266281  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5471  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  28.24 
 
 		 225 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5823  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  27.27 
 
 		 158 aa  43.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1699  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  30.12 
 
 		 181 aa  42.7  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2037  hypothetical protein  42.55 
 
 		 198 aa  42.4  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2071  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  37.5 
 
 		 190 aa  42.4  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3267  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  33.82 
 
 		 271 aa  42.4  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00676892  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2451  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  31.75 
 
 		 204 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0119288  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1596  competence protein ComEA helix-hairpin-helix region  33.78 
 
 		 207 aa  40.8  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4447  comE operon protein 1  29.33 
 
 		 198 aa  40.8  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00373204  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2312  hypothetical protein  39.22 
 
 		 222 aa  40.8  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.92281  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3198  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  32.79 
 
 		 102 aa  40.8  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4553  ComE operon protein 1  30.95 
 
 		 198 aa  40.8  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0361747  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4064  comE operon protein 1  30.95 
 
 		 199 aa  40.8  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0884227  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4226  comE operon protein 1  30.95 
 
 		 199 aa  40.8  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4349  comE operon protein 1  30.95 
 
 		 198 aa  40.4  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000484477 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>