12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0980 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0980  UbiA prenyltransferase  100 
 
 
295 aa  592  1e-168  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.915074  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1505  UbiA prenyltransferase  87.54 
 
 
289 aa  513  1e-144  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1111  UbiA prenyltransferase  79.72 
 
 
289 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0881749  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1440  UbiA prenyltransferase  75.51 
 
 
340 aa  462  1e-129  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1569  UbiA prenyltransferase  79.24 
 
 
289 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1715  prenyltransferase  29.07 
 
 
303 aa  80.9  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0256  prenyltransferase  25.1 
 
 
298 aa  63.5  0.000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.837385  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0340  prenyltransferase  23.32 
 
 
312 aa  58.2  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4538  UbiA prenyltransferase  26.92 
 
 
295 aa  52  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1926  prenyltransferase  25.21 
 
 
307 aa  48.9  0.00009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.556074  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0383  hydroxymethylbutenyl pyrophosphate reductase  28.4 
 
 
577 aa  44.3  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0738  UbiA prenyltransferase  28.32 
 
 
304 aa  44.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>