27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03316 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_03316  transposase  100 
 
 
73 aa  150  5.9999999999999996e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06215  transposase  98.63 
 
 
104 aa  149  1e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.893102  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00951  transposase  98.63 
 
 
104 aa  149  1e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.186614  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03433  ISXoo15 transposase  61.97 
 
 
315 aa  73.2  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01166  transposase  96.97 
 
 
64 aa  72  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.578018  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04083  transposase  96.97 
 
 
64 aa  72  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.951935  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03800  transposase  96.97 
 
 
64 aa  72  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03015  transposase  96.97 
 
 
64 aa  72  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02568  transposase  96.97 
 
 
64 aa  72  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01835  transposase  96.97 
 
 
64 aa  72  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.403808  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01212  transposase  96.97 
 
 
64 aa  72  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04614  transposase  96.97 
 
 
41 aa  71.2  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.512602  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01855  transposase  96.97 
 
 
41 aa  71.2  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1276  integrase catalytic subunit  45.59 
 
 
343 aa  57  0.00000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1990  integrase catalytic region  47.69 
 
 
339 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.653928 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1286  ISXoo15 transposase  54.05 
 
 
183 aa  49.7  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.321435  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3005  integrase catalytic region  41.54 
 
 
326 aa  47.8  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3004  integrase catalytic region  41.54 
 
 
326 aa  47.8  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1557  integrase catalytic region  41.54 
 
 
326 aa  47.8  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0883  integrase catalytic region  41.54 
 
 
326 aa  47.8  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2157  integrase catalytic subunit  45.9 
 
 
342 aa  45.4  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.100699  normal  0.0600961 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3640  integrase  50 
 
 
343 aa  45.1  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0859  Integrase catalytic region  51.11 
 
 
334 aa  43.9  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.54684 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4773  Integrase catalytic region  51.11 
 
 
334 aa  43.9  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5361  Integrase catalytic region  51.11 
 
 
334 aa  43.9  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0052  putative transposase  55.17 
 
 
340 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0690  Integrase catalytic region  51.61 
 
 
409 aa  40.4  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>