18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02389 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_02389    100 
 
 		 240 bp  476  1e-132  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.270456  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00235  putative ISXoo14 transposase  100 
 
 		 1098 bp  400  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02785  putative ISXoo14 transposase  100 
 
 		 1110 bp  305  3.0000000000000004e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00514  putative ISXoo14 transposase  98.53 
 
 		 1002 bp  254  1e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0342548  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3230  transposase IS4 family protein  90.28 
 
 		 1104 bp  87.7  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.431126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4885  transposase IS4 family protein  91.53 
 
 		 1107 bp  77.8  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1171  IS4 family transposase  88.57 
 
 		 1101 bp  75.8  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.56171 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4228  transposase ISRme1  88.57 
 
 		 1101 bp  75.8  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00917968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4153  transposase ISRme1  88.57 
 
 		 1101 bp  75.8  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.504697 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3353  IS4 family transposase  88.57 
 
 		 1101 bp  75.8  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1503    95.12 
 
 		 153 bp  65.9  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123931 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1813    89.09 
 
 		 510 bp  61.9  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3911  transposase  89.09 
 
 		 1110 bp  61.9  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.664589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6919  transposase  89.09 
 
 		 1110 bp  61.9  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.439237 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7153  transposase  89.09 
 
 		 1110 bp  61.9  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4641  transposase, IS4  87.93 
 
 		 669 bp  60  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.395706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4713    87.5 
 
 		 1102 bp  56  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0412243  normal  0.806779 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5975  IS4 family transposase  86.21 
 
 		 1101 bp  52  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.682409  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>