More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01241 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_01241  hypothetical protein  100 
 
 
285 aa  572  1.0000000000000001e-162  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2870  hypothetical protein  84.59 
 
 
284 aa  426  1e-118  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1326  polysaccharide export protein  82.31 
 
 
303 aa  424  1e-117  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.476136  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1420  hypothetical protein  81.23 
 
 
303 aa  419  1e-116  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1017  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  64 
 
 
362 aa  377  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0291426  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3481  putative ATP-binding protein  64.6 
 
 
362 aa  377  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00831009  normal  0.84949 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1786  ATPase-like, ParA/MinD  68.28 
 
 
363 aa  380  1e-104  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000257216  normal  0.0179532 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2189  cobyrinic acid ac-diamide synthase  63.5 
 
 
362 aa  375  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00291769  normal  0.27131 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2621  hypothetical protein  68.15 
 
 
363 aa  374  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.83768  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2767  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  65.67 
 
 
362 aa  364  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2188  protein of unknown function DUF59  63.43 
 
 
363 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.321021 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0052  mrP protein  64.93 
 
 
361 aa  363  1e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0676  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  65.67 
 
 
362 aa  363  1e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0576  hypothetical protein  62.45 
 
 
363 aa  363  2e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0440999  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1588  protein of unknown function DUF59  63.5 
 
 
363 aa  363  2e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2379  MRP family ATP-binding protein  64.55 
 
 
362 aa  361  8e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.384277  hitchhiker  0.0044393 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1360  hypothetical protein  63.97 
 
 
365 aa  360  1e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1163  putative iron sulfur binding protein  64.18 
 
 
365 aa  359  3e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0126108  normal  0.565689 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2592  protein of unknown function DUF59  63.43 
 
 
363 aa  358  4e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.144704 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0858  ParA family protein  64 
 
 
362 aa  358  5e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0920  hypothetical protein  66.54 
 
 
362 aa  358  6e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.536406 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1064  hypothetical protein  66.54 
 
 
362 aa  358  6e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.626095  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1557  hypothetical protein  65.27 
 
 
362 aa  358  6e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1213  putative ATP-binding protein  63.87 
 
 
362 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1042  putative ATP-binding protein  60.82 
 
 
374 aa  356  1.9999999999999998e-97  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.261199  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2985  ParA family protein  63.87 
 
 
362 aa  355  2.9999999999999997e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.206576  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1614  ParA family protein  63.87 
 
 
362 aa  355  2.9999999999999997e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124069  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0712  ParA family protein  63.87 
 
 
362 aa  355  2.9999999999999997e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.220204  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2301  ParA family protein  63.87 
 
 
362 aa  355  2.9999999999999997e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1055  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding protein  63.87 
 
 
362 aa  355  2.9999999999999997e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1061  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding protein  63.87 
 
 
362 aa  355  2.9999999999999997e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.585666  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0972  hypothetical protein  64.81 
 
 
365 aa  355  5.999999999999999e-97  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.642546  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0560  protein of unknown function DUF59  62.69 
 
 
362 aa  353  2e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5766  hypothetical protein  62.55 
 
 
363 aa  352  4e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.151832  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0859  cobyrinic acid ac-diamide synthase  62.18 
 
 
363 aa  351  8e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000753537  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2482  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  62.18 
 
 
363 aa  351  8.999999999999999e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3272  putative iron sulfur binding protein  61.94 
 
 
363 aa  350  1e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3476  hypothetical protein  64.55 
 
 
363 aa  350  2e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0863865  normal  0.308541 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2348  cobyrinic acid ac-diamide synthase  62.18 
 
 
363 aa  350  2e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0602957 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2800  protein of unknown function DUF59  64.55 
 
 
363 aa  349  2e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.183179  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0931  putative iron sulfur binding protein  63.43 
 
 
363 aa  348  4e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  61.82 
 
 
363 aa  348  6e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000091125  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1824  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  61.82 
 
 
363 aa  348  7e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16472  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2435  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  61.82 
 
 
363 aa  348  7e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00757456  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1403  hypothetical protein  61.89 
 
 
362 aa  346  2e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2108  chromosome partitioning ATPase protein  61.13 
 
 
362 aa  345  4e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.873429  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1966  hypothetical protein  64.26 
 
 
362 aa  345  4e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4075  protein of unknown function DUF59  63.81 
 
 
363 aa  341  8e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1846  hypothetical protein  61.57 
 
 
363 aa  341  9e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2287  chromosome partitioning ATPase protein  61.28 
 
 
358 aa  340  2e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000432977 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2661  Mrp protein  61.28 
 
 
358 aa  340  2e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2755  hypothetical protein  64.64 
 
 
364 aa  340  2e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.153981 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3885  ParA family protein  61.05 
 
 
364 aa  339  4e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.257369  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1710  hypothetical protein  62.69 
 
 
363 aa  339  4e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.289502  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3830  hypothetical protein  66.67 
 
 
363 aa  338  4e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.358406  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1127  hypothetical protein  61.31 
 
 
364 aa  335  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4146  ParA family protein  60.3 
 
 
364 aa  333  2e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4314  hypothetical protein  61.8 
 
 
364 aa  333  2e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4506  ParA family protein  62.17 
 
 
364 aa  333  2e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000372356 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1098  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  61.42 
 
 
364 aa  332  6e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.285598  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1138  hypothetical protein  61.42 
 
 
364 aa  331  7.000000000000001e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.192644  normal  0.84977 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0822  hypothetical protein  62.31 
 
 
363 aa  331  8e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1180  putative ATPase  62.55 
 
 
373 aa  331  1e-89  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1878  NifH/FrxC domain-containing protein  60.22 
 
 
306 aa  325  6e-88  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1645  hypothetical protein  59.19 
 
 
364 aa  325  7e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1406  hypothetical protein  60.07 
 
 
362 aa  324  9e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.295791  normal  0.937662 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1547  ParA family protein  55.56 
 
 
356 aa  323  2e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.97129  hitchhiker  0.000107443 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19065  hypothetical protein  59.85 
 
 
364 aa  323  2e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0441543 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0940  hypothetical protein  61.02 
 
 
388 aa  323  2e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2245  ATP-binding protein, Mrp/Nbp35 family protein  59.48 
 
 
371 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.615288  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2227  hypothetical protein  61.29 
 
 
355 aa  320  1.9999999999999998e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.221852  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0423  ATPase-like, ParA/MinD  62.7 
 
 
376 aa  319  3e-86  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1590  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  61.3 
 
 
408 aa  318  5e-86  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2618  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  60.59 
 
 
371 aa  318  6e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1426  ATP-binding protein  61.69 
 
 
408 aa  318  6e-86  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.904021  normal  0.20108 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19290  small P-loop ATPase  59.57 
 
 
364 aa  317  1e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2392  putative ATPase  60.89 
 
 
369 aa  317  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3043  putative ATPase  62.1 
 
 
369 aa  317  1e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3196  putative ATPase  58.4 
 
 
370 aa  317  2e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00833341  decreased coverage  0.00111363 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2553  putative ATPase  58.4 
 
 
370 aa  317  2e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2720  putative ATPase  62.1 
 
 
369 aa  316  2e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2454  putative ATPase  58.4 
 
 
370 aa  317  2e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.802299  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1288  putative ATPase  61.69 
 
 
369 aa  316  3e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.936  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1887  Mrp protein  59.27 
 
 
371 aa  315  4e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000179965  normal  0.0176835 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2457  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  59.27 
 
 
371 aa  315  4e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000583453  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2219  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  59.85 
 
 
373 aa  315  4e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0695756  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2577  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  59.27 
 
 
371 aa  315  4e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0252936  normal  0.0451868 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2464  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  59.27 
 
 
371 aa  315  4e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00489956  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2872  putative ATPase  61.29 
 
 
369 aa  315  5e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0555  mrp protein  58.78 
 
 
382 aa  314  9e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.414747  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2838  putative mrp protein  56.6 
 
 
391 aa  313  1.9999999999999998e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0284462  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2048  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  58.57 
 
 
370 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.912388  normal  0.694942 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02043  antiporter inner membrane protein  60.89 
 
 
369 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.841593  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1544  Mrp protein  60.89 
 
 
369 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.575104  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3096  putative ATPase  60.89 
 
 
369 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2403  putative ATPase  60.89 
 
 
369 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1574  putative ATPase  60.31 
 
 
370 aa  313  2.9999999999999996e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.473221 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0855  putative ATPase  60.89 
 
 
369 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.854635  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1761  ATP-binding Mrp/Nbp35 family protein  60.22 
 
 
371 aa  312  2.9999999999999996e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.169939  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0930  putative ATPase  60.89 
 
 
369 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>