16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00773 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_00773  hypothetical protein  100 
 
 
175 aa  347  7e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0101845  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1321  hypothetical protein  71.43 
 
 
175 aa  253  6e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193579  normal  0.134075 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2216  hypothetical protein  77.78 
 
 
175 aa  253  8e-67  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.173018  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2126  hypothetical protein  77.78 
 
 
175 aa  253  8e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.742072  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0792  hypothetical protein  39.77 
 
 
167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.631471  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00184  hypothetical protein  36.78 
 
 
165 aa  106  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1826  hypothetical protein  36.87 
 
 
167 aa  97.1  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2832  hypothetical protein  33.53 
 
 
171 aa  84.3  9e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0989794  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0355  hypothetical protein  31.79 
 
 
179 aa  81.3  0.000000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4685  hypothetical protein  33.9 
 
 
189 aa  79.7  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0057537 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0766  protein of unknown function UPF0227  30.1 
 
 
213 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0182616  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0766  protein of unknown function UPF0227  30.1 
 
 
213 aa  53.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.166666  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0278  hypothetical protein  27.22 
 
 
200 aa  52.8  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.126418  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0729  hypothetical protein  29.13 
 
 
213 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.151283  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4098  protein of unknown function UPF0227  27.27 
 
 
222 aa  45.8  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2583  putative hydrolase alpha/beta fold  26.5 
 
 
219 aa  41.2  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.141218  normal  0.364663 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>