29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5053 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5053  hypothetical protein  100 
 
 		 107 aa  207  3e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0470  hypothetical protein  99.07 
 
 		 107 aa  206  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5328  hypothetical protein  84.11 
 
 		 107 aa  164  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.419726 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0363  hypothetical protein  82.24 
 
 		 108 aa  150  5e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0669807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4975  hypothetical protein  79.44 
 
 		 108 aa  146  7e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5102  hypothetical protein  79.44 
 
 		 108 aa  146  7e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5152  hypothetical protein  79.44 
 
 		 108 aa  146  7e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.456332  normal  0.766946 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05030  hypothetical protein  56.07 
 
 		 107 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0484  hypothetical protein  56.07 
 
 		 107 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4164  hypothetical protein  50.47 
 
 		 107 aa  120  7e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0432807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0514  hypothetical protein  38.32 
 
 		 110 aa  78.6  0.00000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  3.95823e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1777  hypothetical protein  27.36 
 
 		 112 aa  57  0.00000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.297893  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3959  hypothetical protein  29.52 
 
 		 109 aa  53.5  0.0000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0054  hypothetical protein  27.1 
 
 		 111 aa  50.1  0.000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3780  hypothetical protein  28.04 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3906  hypothetical protein  28.04 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3038  hypothetical protein  32.35 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.47742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0545  hypothetical protein  28.04 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3723  hypothetical protein  28.04 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0784  hypothetical protein  32.1 
 
 		 114 aa  47.8  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000145033 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0808  hypothetical protein  31.46 
 
 		 122 aa  47.4  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3293  hypothetical protein  29.89 
 
 		 111 aa  47  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00427  hypothetical protein  26.47 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3553  hypothetical protein  28.09 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0584  hypothetical protein  28.74 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3445  hypothetical protein  28.74 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0585  hypothetical protein  28.74 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.182991 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4184  hypothetical protein  30.34 
 
 		 110 aa  44.7  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0586  hypothetical protein  26.44 
 
 		 111 aa  44.3  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>